scRNA_seq:单细胞转录组测序简介

最新推荐文章于 2024-11-21 10:59:41 发布
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scRNA_seq是单细胞测序技术的一种，旨在克服细胞异质性，提高科研精度。10X Genomics的Chromium Controller在其中扮演关键角色，通过特定的 Gel Beads 和油滴技术实现单细胞分离与文库制备。该技术广泛应用于CNV检测、ATAC_seq等领域，尤其是单细胞转录组分析。整个过程包括细胞捕获、转录本扩增和文库构建，最终进行 Illumina 上机测序。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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在传统的测序技术中，上机测序的样本是由多个细胞构成的，最后分析得出的结论也只是基于所有细胞的平均水平，但是我们知道细胞是具有异质性的，对于大脑等复杂组织而言，其细胞类型是多样的；对于肿瘤细胞而言，其细胞异质性更是尤为突出，为了克服细胞异质性的影响，提高科学研究的精度，科学家在不断尝试，希望从单个细胞的水平去进行测序分析。

从2009年开始，各种单细胞技术不断出现，最初由于其通量低，操作繁琐，价格高等一系列因素，导致其应用并不广泛，近年来随着技术的不断发展，通量在不断提升，价格也在不断下降，单细胞测序技术越来越成熟，出现了很多成熟的平台，比如本文要介绍的10X  Genomics。

单细胞测序的应用领域非常多，比如CNV检测，ATAC_seq等, 其中引起广泛关注的，就是单细胞在转录组学的应用，即single cell RNA sequencing, 简称scRNA-seq。官方提供的流程如下

10X Genomics公司也为之提供了一系列配套的仪器和软件，最核心的就是分离细胞，制备文库的机器，叫做Chromium Controller, 图片如下

核心是通过构建GE

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