本文详细介绍了单细胞转录组数据分析，重点聚焦于10X Genomics平台的cell ranger软件及其在scRNA_seq中的应用。内容包括scRNA_seq的优势、cell ranger的使用流程以及配套的R包如Seurat和scater等，展示了scRNA_seq在发育、肿瘤研究中的广泛应用。
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single cell RNA sequencing,简称scRNA_seq, 指的是针对单个细胞的RNA进行分析。传统的转录组分析其样本为多种细胞的混合物，称之为bulk RNA seq, 而scRNA则针对单个细胞进行分析，避免了细胞异质性的问题，对于肿瘤等异质性强的组织,scRNA有着巨大优势。
同时scRNA可以对细胞亚群进行划分，研究细胞谱系，进一步了解和完善细胞分化过程。目前scRNA的研究可谓是如火如荼，本文整理了scRNA数据分析的相关资料。
10X Genomics平台是目前最主流的单细胞平台，除了完整的文库制备外，还集成了对应的数据分析软件cell ranger
除了cell ranger外，还有一些下游分析的R包
单细胞转录组技术在发育进化， 肿瘤等疾病的研究领域有着广泛的应用前景，以上的资料只能算是基础概念的扫盲，更多的高级分析还需要深入学习。
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