ComplexHeatmap绘制热图（一）

讲起热图，大家都会比较熟悉，绘制热图方式比较多，这里介绍的是ComplexHeatmap包绘制热图，首先配置数据，这里的自动生成一个10X10的矩阵

data=matrix(rnorm(100),nrow=10)
colnames(data)=paste0('sample',1:10)
rownames(data)=paste0('gene',1:10)
head(data)

加载R包

library(ComplexHeatmap)
Heatmap(data,
        col=c('blue','white','red'),
        cluster_rows = TRUE, 
        cluster_columns = TRUE)

基本的热图就已经出来了，里面的参数很多，可以查一下帮助文档
增加一个标题，并将位置放在底部

Heatmap(data,
        col=c('blue','white','red'),
        cluster_rows = TRUE, 
        cluster_columns = TRUE,
        column_title = "samples",
        column_title_side="bottom")

修改图例的标题

Heatmap(data,
        col=c('blue','white','red'),
        cluster_rows = TRUE, 
        cluster_columns = TRUE,
        name='expression',
        column_title = "samples",
        column_title_side="bottom")

当然ComplexHeatmap包绘制的热图不仅仅是这样的，今天只是简单的介绍这个包的基本使用