AKI病人筛选

该博客介绍了如何使用MIMIC III数据集进行AKI病人的筛选和时序数据分析,包括生成不同表格如vitals、labs、sedatives等,以及涉及的SQL脚本和Python文件操作。内容涵盖数据提取、物化视图、时序表的创建,并讨论了在处理过程中遇到的问题和解决方案。
摘要由CSDN通过智能技术生成

EXTRACT THE DATA

使用了 MIMIC III 数据集。预期的数据文件是:

  • kdigo_stages_measured.csv 包含肌酐的时间序列测量值、过去 6 小时、12 小时和 24 小时的尿量以及相应的标签。(time-series measurements of creatinine, urine output for the last six, 12 and 24 hours and the respective labels.)
  • icusstay_detail-kdigo_stages_measured.csv 包含患者人口统计的非时间变量,例如:年龄(数字)、性别(二元)、种族组(分类)和入院类型(分类)。( non-temporal variables of patient demographics such as: age (numerical), gender (binary), ethnicity group (categorical) and type of admission (categorical).)
  • labs-kdigo_stages_measured.csv 包含实验室测试的时间序列数据。(time-series data of the laboratory tests.)
  • vitals-kdigo_stages_measured
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