187. 重复的DNA序列

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题目.

难度:

middle

解答：

因为基因序列是一定的，并且长度也是一定的，所以可以转化为整数来运行，因为只有哦四个基因，所以2bit就满足了，10个基因一共需要20个bit，在一个int的长度之内。

package main

import "fmt"

func num(b byte) uint {
	switch b {
	case 'A':
		return 0
	case 'C':
		return 1
	case 'G':
		return 2
	case 'T':
		return 3
	}

	return 0
}

func findRepeatedDnaSequences(s string) []string {
	if len(s) <= 10 {
		return nil
	}

	result := make([]string, 0)
	appearMap := make(map[uint]bool)
	collectMap := make(map[uint]bool)

	prev := uint(0)
	for i := 0; i <= 9; i++ {
		prev = (prev << 2) + num(s[i])
	}

	appearMap[prev] = true

	for i := 10; i < len(s); i++ {
		prev = (prev << 2) + num(s[i])
		prev &= 0xFFFFF

		if appearMap[prev] && !collectMap[prev] {
			result = append(result, s[i-9:i+1])
			collectMap[prev] = true
		} else {
			appearMap[prev] = true
		}
	}

	return result
}

func main() {
	fmt.Println(findRepeatedDnaSequences("AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"))
}

复杂度分析

time

O(n)

space

O(N)

执行结果

执行用时 :
12 ms
, 在所有 Go 提交中击败了
97.69%
的用户
内存消耗 :
6.7 MB
, 在所有 Go 提交中击败了
100.00%
的用户