代码+视频教程,用WGCNA进行组学数据挖掘

本文介绍了WGCNA(WeightedGeneCo-expressionNetworkAnalysis)在生物科学中的应用,包括概念、流程、数据处理、模块评估、生物信息学分析以及实际案例。讲师刘伟分享了他在福建农林大学的科研经验和教学资源。读者可通过微科盟获取相关讲座资料。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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01

课程简介

WGCNA(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,权重基因共表达网络分析)是一种分析多个样本基因表达模式的方法。WGCNA可以对表达模式相似的基因进行聚类,并分析模块与特定性状或表型之间的关联关系,主要用于分析性状和基因之间的关系。

课程所讲内容共包括7部分:1.WGCNA:概念、意义和能解决的问题2.WGCNA的一般流程;3. 转录组原始数据的处理;4. 模块稳定性的评估(有代码);5. 生物信息学分析(GO功能注、KEGG通路注释、共表达网络可视化(Cytoscape为例)、 其他分析(生存分析,模块差异分析,数据库构建等)) ;6. WGCNA在论文中的实际使用举例;7. 单个或多个基因为种子的共表达网络分析(软件使用)

02

讲师简介

刘伟,博士,现就职于福建农林大学,从事生物信息学研究,主要研究内容为使用蛋白质组学,转录组学和基因组学分析生物学问题。主持国自科基金青年项目1项,发表SCI论文14篇,参与高教社《简明蛋白质组学》教材编写,开发多个免费生物信息学工具并共享代码,受邀为Frontiers in Genetics,Frontiers in Plant Science,Frontiers in Pharmacology,mSystems,Scientific Reports,Journal of Oncology和Briefings in Bioinformatics等期刊审稿,具有非常丰富的组学数据分析经验。

03

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