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原创 R语者小case之——从KEGG原始网页批量生成通路的基因表格

R语者小case——从差异表达的结果读取GSEA的input欢迎使用Markdown编辑器你好! 这是你第一次使用 Markdown编辑器 所展示的欢迎页。如果你想学习如何使用Markdown编辑器, 可以仔细阅读这篇文章,了解一下Markdown的基本语法知识。新的改变我们对Markdown编辑器进行了一些功能拓展与语法支持,除了标准的Markdown编辑器功能,我们增加了如下几点新功能,帮助你用它写博客:全新的界面设计 ,将会带来全新的写作体验;在创作中心设置你喜爱的代码高亮样式,Mark

2021-07-15 23:59:51 955

原创 R语者小case之——从简历文字生成履职表

简单材料:陈*先生:1965年出生,中国国籍,无永久境外居留权,本科学历。1985年7月至1995年2月,任安徽省安庆市宿松财政局公务员;1995年3月至1997年2月,担任深圳华通会计师事务所项目经理;1997年3月至1998年10月,担任深圳冠利达必是食品公司财务经理;1998年11月至2004年5月,担任丽斯达日化(深圳)公司财务总监;2004年6月至2006年8月,担任富安娜家居股份有限公司财务总监;2006年11月至2007年10月,担任万达商业管理有限公司副总经理;2007年11月至2012

2021-06-21 16:40:48 160

原创 R语者小case之——巧用table函数做多变量分类统计

表中记录了两家医院在多年间分娩的产妇使用某种药物的信息。要求计算出使用药物的产妇的比例,绘制成如下的图。library("readxl")library("ggplot2")library("tidyverse")library("stringr")# Read-in datadf <- read_excel("data.xlsx", sheet = 1)#读取数据str(df)#看看数据结构tibble [305 x 5] (S3: tbl_df/tbl/data.frame).

2021-06-21 16:37:03 1565

原创 R语者小case之——从GTF文件生成注释表格做基因ID转换

> 基因的注释表格是经常需要用到的,可以从GTF文件中获得。用R可以简单地实现这个功能。简易的GTF文件实际上可以认为是**用制表符分隔为9列**的TSV。第一列是seqid, 通常是染色体编号;第二列是source,表示信息的来源;第三列是feature,表示类型;第四和第五列分别是区间的起始位置与终止位置;第六列是score, 软件提供的统计值;第七列是strand, 代表正负链的信息, +表示正链,-表示负链,?表示不清楚正负链的信息;第八列是phase,当第三列是CDS时,需

2021-06-21 16:33:37 3614

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