常用安装R包

最新推荐文章于 2024-11-29 19:49:36 发布
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分类专栏： 大数据数据分析：R语言 文章标签： r语言 java 前端
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本文介绍了如何在R环境中安装并使用clusterProfiler和org.Hs.eg.db这两个生物信息学常用的包，为基因集富集分析提供支持。
摘要由CSDN通过智能技术生成

目录

安装clusterProfiler包

if (!requireNamespace("devtools", quietly = TRUE)) {
    install.packages("devtools")
}
devtools::install_bioconductor("clusterProfiler")

 安装org.Hs.eg.db包

BiocManager::install("org.Hs.eg.db")

org.Hs.eg.db_3.5.0.tar.gz下载一直报错
05-26
因为上次在Rstudio里面下hgu95av2.db包的时候，其中的org.Hs.eg.db_3.5.0.tar.gz下载一直报错，上网搜了一通，说什么镜像问题，结果换了镜像也没解决，后面直接找个法子本地安装了
Rstudio安装org.Hs.eg.db
ZH_DDong的博客
08-24 2万+
自己也是个小白，初次安装org.Hs.eg.db碰到好多问题，步骤总结如下： 第一，instal.packages（）安装，不行则换 BiocManager：：install（） 第二，如BiocManager不成，说明不是最新版本，可按提示安装最新版 BiocManager::install(version = '3.13') #由于R版本较新，按照提示中的相关信息，安装最新版本的 第三，再次安装 BiocManager：：install("org.Hs.eg.db") 第四，之后每个人.
org.Hs.eg.db安装
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04-11 2万+
org.Hs.eg.db安装 我先把问题解决的办法给出来吧。这个是安装成功了的。 1.去http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html下载安装包 但是你要注意自己下载的位置在哪，记住路径。后面安装的时候会用到的。 然后直接在你的R里面输入以下的代码，记得额，前面的路径和包名要对...
org.Hs.eg.db包安装
最新发布
m0_64335048的博客
11-29 669
install.packages("org.Hs.eg.db_3.20.0.tar.gz", lib="下载的包路径")#都不成功，同时下载了本地包，可以把包放到R所在的本地文件位置进行安装（最终成功！
org.Hs.eg.db使用--持续修改
ziixiaoshenwang的博客
11-23 1427
【代码】org.Hs.eg.db使用--持续修改。
人类基因组注释包org.Hs.eg.db
qq_27390023的博客
12-30 6442
org.Hs.eg.db包主要注释人类基因：不同数据库ID间的转化。 # if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) # install.packages("BiocManager") # # BiocManager::install("org.Hs.eg.db") library(org.Hs.eg.db) ls("package:org.Hs.eg.db") # 查看包的信息 keytypes(org.Hs.eg.db)
R语言笔记——”org.Hs.eg.db“脱坑记录
努力努力努力再努力
08-19 1万+
R语言笔记——”org.Hs.eg.db“脱坑记录 ”org.Hs.eg.db“是发布在bioconductor平台上面的一个数据库文件，该包中装有较多的主流数据资料文件，但是小编在安装该包的过程中遇到了一些问题，通过浏览各大平台的资料以及自己实操，现已解决”org.Hs.eg.db“包的安装问题，接下来对于该包安装过程中遇到的问题进行简要分享。 1."BiocManager"包 下载"BiocManager"包中的问题 if (!requireNamespace("BiocManager", qu
org.hs.eg.db安装包教会
2301_82025136的博客
02-24 1971
org.hs.eg.db win11 rstudio安装包教会。
R-rattle安装说明及所需程序包
01-04
在R语言环境中，Rattle（R图形用户界面的数据挖掘工具）是一个非常实用的包，它为数据挖掘提供了直观的图形用户界面（GUI）。然而，由于Rattle已经停止更新，找到适用于最新版本R的安装方法变得有些挑战性。本文将...
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头疼的org.Hs.eg.db还是没有下载好
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求助，希望能安装好……
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03-16 2234
小白终于下载了org.Hs.erg.db等包，终于能用R进行基因富集和KEGG通路分析了！
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我是4.4，所以下载这里的org.Hs.eg.db3.19.1.版本。尝试一：重新安装，找到R包安装目录，进去删掉包，重新install.packages("org.Hs.eg.db")，一样的报错。运行> require("org.Hs.eg.db") 看下效果，我的目的是使用pathview，成功解决。错误: 程序包‘org.Hs.eg.db’是在R版本3.0.0之前建的：你得重新安装。安装程序包‘org.Hs.eg.db’library后报错。查看，R4.4版本使用下述代码安装，直接运行。
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R语言统计分析与常用程序包详解
"这篇资源是关于R语言的介绍，特别是常用R程序包的第二部分，主要涵盖Graphics、lattice、maptools、mefa、mgcv、mvpart、nlme、ouch、pgirmess和phangorn等包在绘图、空间分析、生态学和系统发育分析中的应用。...
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