文本挖掘
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坦帕湾的海盗
莫道君行早,更有早行人
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BERN2(生物医学领域)命名实体识别与命名规范化工具
生物医学文本挖掘的重要性:随着生物医学文本量的不断增长,NER和NEN工具变得越来越重要,它们可以自动注释文本中的实体,并将它们链接到唯一的概念ID(CUIs)。:BERN2是一个工具,它通过使用多任务NER模型和基于神经网络的NEN模型,提高了之前基于神经网络的NER工具的速度和准确性。性能提升:BERN2通过使用单一的多任务NER模型和结合规则和神经网络的NEN模型,显著减少了注释时间并提高了实体规范化的质量。5.2 命名实体规范化 (NEN) 准确性。5.1 命名实体识别 (NER) 性能。原创 2024-09-07 22:21:10 · 735 阅读 · 1 评论 -
生物信息与遗传医学前沿AI网站平台概览二
生物信息与遗传医学前沿AI网站平台概览二原创 2024-08-20 21:34:48 · 587 阅读 · 0 评论 -
Variomes:支持基因组变异筛选的高召回率搜索引擎
在对803个查询进行测试时,Variomes平均检索到比LitVar多21.3%的文章,并在90%的查询中返回与LitVar相同或更多的结果,从而为搜索有关变异的文献建立了新的基准。可用性和实现(Availability and implementation):Variomes公开可用,源代码也可在GitHub获取,链接已放在文章开头。原创 2024-08-19 15:04:32 · 800 阅读 · 0 评论 -
【牛津大学最新研究】医学GraphRAG:用知识图谱打造安全的医疗AI新时代!
我们介绍了一个名为MedGraphRAG的新型基于图的检索增强生成(RAG)框架,专门为医疗领域设计,旨在增强大型语言模型(LLM)的能力并生成基于证据的结果,从而在处理私人医疗数据时提高安全性和可靠性。尽管LLAMA2的具体细节可能具有假设或推测的性质,但人们可以期待它将继续关注强大、全面的语言分析,完善工具和方法,以更好地衡量语言理解和生成中的细微差别。在其前身LLAMA和LLAMA2的成功基础上,LLAMA3融合了更复杂的算法和更广泛的数据集,以增强其在各种语言任务中的表现。原创 2024-08-16 21:32:17 · 1416 阅读 · 0 评论 -
生物医学文献文本挖掘语料库、模型及工具速览一
速览一包含了十篇文献,主要以PubTator为核心文献,展开到与之相关的文献,快速了解相关工作情况。原创 2024-08-14 14:47:17 · 990 阅读 · 1 评论 -
PubTator 3.0:用于挖掘生物医学知识的人工智能驱动的文献资源网站
PubTator 3.0是一个生物医学文献资源挖掘网站工具,使用最先进的人工智能技术为蛋白质、遗传变异、疾病和化学品等关键概念提供语义和关系搜索。它目前提供了超过10亿个实体和关系注释,涵盖了来自PMC开放获取子集的约3600万篇PubMed摘要和600万篇全文文章,每周更新。PubTator 3.0检索的文章数量比PubMed或Google Scholar更多。文章进一步表明,将ChatGPT(GPT-4)与PubTator API集成可以显着提高其响应的真实性和可验证性。原创 2024-08-16 09:47:02 · 1156 阅读 · 0 评论 -
生物医学命名实体识别AIO新模式?带飞一众基模型,吊打多任务学习?
生物医学命名实体识别(BioNER),顾名思义,旨在自动识别自然语言文本中的生物医学实体。就像新能源汽车产业链,没有上游的锂矿业怎么实践电池技术?没有中游的电池技术,怎么造新能源汽车?类似的,没有实体识别就无法完成关系提取、知识图谱、智能问答系统等下游文本挖掘任务,BioNER是必要基础。原创 2024-08-15 09:18:16 · 1007 阅读 · 0 评论