
【GEOquery包学习】
上面两种的区别在于,第一种是一个GSE文件,包含list(包含一些附注)、另一个list(包含所有GSM文件)也就是说、一堆GPL。第二种是一个只有一个元素的list,元素是expressionSet(内含MIAME文件、AnnotatedDataFrame、Version),这些文件格式均来自biobase包。要注意,上面的2553恰好所有对象都是一个GPL,如果一个GSE有多个GPL要先过滤然后取出里面的表达矩阵、分组信息,自己创建一个ExpressionSets。1、GDS是GDS文件,






