GEO、TCGA数据下载慢 下载中断解决办法

已于 2022-04-28 11:02:18 修改
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于 2022-04-03 09:53:29 首次发布
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博客介绍了如何使用西柚云代理下载工具解决GEO和TCGA数据库下载慢或中断的问题。该工具提供免费的代理服务，用户只需复制数据链接到指定邮箱，即可通过邮件接收下载链接。对于tar格式文件，需要额外提取下载链接。此外，还提供了TCGA数据下载的教程链接。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

很多同学下载GEO数据库的数据和TCGA的数据网速特别的慢，或者总是中断，生信之路的第一个跟头就摔在了数据下载

下面给大家分享一个下载神器——西柚云代理下载！

https://fileproxy.xiyoucloud.net/#/

首先在GEO数据库上面找到您所需要的数据，然后页面往下拉

找到Series Matrix File(s)，点进去

 找到您要下载的文件，右键-复制链接地址

打开我们的代理下载网站

https://fileproxy.xiyoucloud.net/#/

输入您用于接收下载链接的邮箱

把上一步复制的链接粘贴到下载地址

点提交信息

下载完成后会自动发送到预留邮箱里面

tar数据直接复制粘贴进去会提示url非法，这个是因为还需要进一步提取下载链接才能下载，具体方法可以参考网站里面的教程

 TCGA的使用教程可以看网站里面的教程，篇幅有限就不一一列举了。

最重要的是！！！这个代理下载服务是完全免费的！！！

西柚云
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新版TCGA下载数据的3种方法：①直接网站下载，通过cart购物车下载：速度快，但不能下载超过5G数据。②使用官方GDC-UI软件下载。可能会失败。③使用官方GDC-client软件下载。速度快，容易能成功。
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目前Biomamba生信基地最大的矛盾就是菜逼Biomamba孱弱的能力与日益增长的粉丝需求之间的矛盾。早期的很多分析都已然是青椒，面临着基金申报的压力。，以后不定期更新，方便大家获快速获得自己需要的教程。当然，最好的方式还是按照自己的需求直接用关键词在公众号中检索。总有同学在添加我们时询问我们有哪些教程，这很难回答，毕竟我们光原创内容就有。我们的公众号有一部分订阅内容，下面列出来给大家，我们目前开放终身订阅~欢迎各界人士的交流与合作，一同开启生物信息学之旅。
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外网下载数据集非常慢的解决办法
xiaoxian666的博客
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外网下载数据集非常慢的解决办法
TCGA数据下载速度慢
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### 提高TCGA数据下载速度的方法 当遇到TCGA数据下载缓慢或中断的情况时，可以采取多种策略来优化下载过程并确保顺利完成下载任务。 #### 使用专门的下载工具 为了更高效地管理大文件传输，建议采用专业的下载管理器。这类软件能够支持断点续传功能，在网络不稳定情况下尤为有用。此外，部分工具还提供批量下载选项，允许一次性提交多个URL请求[^1]。 #### 获取有效的直接下载链接 有时简单的复制粘贴官方提供的tar格式资源地址并不能成功发起下载操作，这是因为实际可用的下载路径可能隐藏于页面内部或是经过加密处理后的形式存在。此时应当依照官方网站指南说明去解析出确切可访问的HTTP(S) URL字符串再尝试获取目标文件。 #### 利用第三方服务加速 考虑到个人计算机性能差异以及带宽限制因素影响较大，借助外部服务商的力量不失为明智之举。某些机构或团队专注于生物信息学领域研究工作多年积累下来的经验和技术优势可以帮助用户更快捷稳定地取得所需资料。例如，“SCI狂人团队”就提供了付费辅助下载的服务方案供有需求者选择使用[^2]。 #### 合理规划时间避开高峰时段 互联网流量分布具有周期性特点，通常白天尤其是上班时间段内网速相对较慢；而夜晚至凌晨则相对宽松些。因此可以根据自身实际情况灵活安排下载作业执行时机以获得更好的体验效果。 ```bash # 示例命令：设置定时任务在夜间自动启动下载程序 echo "0 2 * * * wget -c http://example.com/large_dataset.tar.gz" | crontab - ```
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