weixin_69556916的博客

解决了这个问题后又出现了其他报错：~x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lR: No such file or directory。然后查找~x86_64-conda-linux-gnu/bin/lib下的相对应的函式库文件(.so) 的symbolic link 是否正确（即libR.so）这个报错的意思是编译过程找不到对应库文件，-lR表示的是链接库文件libR.so。安装x86_64-conda-linux-gnu-cc。当不存在是，创建软连接。

解决方法：先删除原有的conda-libmamba-solver，然后重新安装。

第二步：我这里报错的原因是由于NumPy 2.0.1版本与一些模块不兼容导致的。第三步：这里报错的原因是：scipy 的版本是1.7.2，与降级后的numpy-1.26.4不兼容，解决方法是对scipy升级版本（截止目前最新的版本是1.14.1。然后重新使用pyinstaller打包，这里发现之前的报错信息没有出现了，说明打包的问题已解决。

一般这个库的命令在：“`~/miniconda3/lib/python3.12/site-packages/matplotlib/”，进入此路径，并继续进入此路径下的/mpl-data/fonts/ttf，把下载好的中文字体复制到此路径下。这里建议把这个文件同时复制到matplotlib库下的字体目录，我试验过，没有复制的情况下不会影响输出，但是为了长期使用不会出错，还是建议复制一份到该库的目录里。第一种情况：若运行结果不为空，则直接在脚本里加上这几行即可。最后，再重新验证即可。

解决方法：打开对应目录下的utils.py编辑，将“pd.tslib.Timestamp”修改为“pd.Timestamp”，如下图。

之后，from docx import Document 就不会报错了。

m行的矩阵与n行的矩阵rbind()最后变成m+n行，合并前提：rbind(a, b)中矩阵a、b的列数必需相符。，m列的矩阵与n列的矩阵cbind()最后变成m+n列，合并前提：cbind(a, b)中矩阵a、b的行数必需相符。在R语言中，我们可以利用函数cbind() 和rbind() 把向量和矩阵拼成一个新的矩阵。cbind（列方式）： 把矩阵横向合并成一个大矩阵，根据列进行合并，即。rbind（行方式）： 纵向合并，根据行进行合并，就是。

如果你需要广泛的注释信息和较少的配置工作，VEP可能是不错的选择。无论你选择哪个工具，这些工具都是生物信息学研究中不可或缺的工具，有助于解释基因组变异的生物学含义。它的主要功能包括确定变异的功能影响、注释突变的影响，例如非同义突变、错义突变和无义突变等，并根据数据库提供的信息进行变异分类。它支持多种基因组版本，可以识别和注释各种类型的变异，如单核苷酸变异、插入/删除、结构变异等。VEP还提供了丰富的注释信息，包括变异的功能、频率、疾病相关性等，可以帮助研究人员更全面地了解变异的生物学意义。

cfDNA含量很低，大部分为1~100ng/mL，90%的健康个体每毫升血液中的cfDNA量不超过25ng，而肿瘤发生和进展时cfDNA量会明显增高，多数研究认为，在肿瘤细胞坏死，凋亡即自分泌过程中均可释放一定量的ctDNA进入血液循环系统。ctDNA来自肿瘤细胞的体细胞突变，因此，ctDNA是一种特征性的肿瘤生物标志物，可被定性、定量和追踪。对于无法获取足够的组织标本的肿瘤患者，例如无法进行活检或手术、穿刺受检者严重不适感、取材时间点受限、很难进行多次取样、肿瘤异质性等情况，更适合做ctDNA业态活检。

一个表格里有两个子表，sheet1里有A、B两列。而sheet2里只有A列信息、B列是空白的，现在的目的是根据sheet2中的A列信息查找sheet1中A列对应的B列信息，补充sheet2的B列对应的信息。

勾选show results in a new window，这是结果在新页面展示的意思，最后点击Get Primers。点击进去，在Primer Parameters里将primerbank里检索到的引物序列粘贴上去。引物length一般在15-30bp，常用的为18-27bp，但不应大于38bp。Tm值范围为55-65°C，上下游引物Tm值不宜相差太大，最好不要超过5度。显示字母为不匹配，不匹配的多于5到6个说明引物不太合适。GC%一般为40%-60%，以45-55%为宜。第一步，先在NCBI官网。

首先是升级pip：然后安装模块：将模块升级到最高版本：然后就可以解决了！！！

官方文档#打开命令行终端，执行命令下载obsutil工具#在软件包所在目录，执行以下解压命令。#进入obsutil所在目录，执行以下命令，为obsutil增加可执行权限#继续在目录中执行以下命令，如果能顺利返回obsutil版本号，说明安装成功。#使用永久AK、SK进行初始化配置：ak-k=sk-e=endpoint#使用临时AK、SK、SecurityToken进行初始化配置：ak-k=sk-t=token-e=endpoint其中，ak即。

virsorter setup -d db -j 4 （这里的4代表用4个线程运行，这里可修改为自己服务器对应的线程，线程越大，运行越快）#激活vs2环境后使用-j 4个线程运行，输入all 所有结果，-w指定输入结果的文件夹。final-viral-score.tsv —— 表示每条序列的各分类类别得分表格。官方推荐的安装方法是用mamba安装，若没安装有mamba，可参考我这篇博文先安装mamba。final-viral-boundary.tsv —— 表示每条序列的信息表格。

方法2，通过官网下载源代码。

【代码】mamba的安装教程。

它们的模型形式基本上相同，都具有 w‘x+b，其中w和b是待求参数，其区别在于他们的因变量不同，多重线性回归直接将w‘x+b作为因变量，即y =w‘x+b，而logistic回归则通过函数L将w‘x+b对应一个隐状态p，p =L(w‘x+b),然后根据p 与1-p的大小决定因变量的值。k均值聚类算法是一种迭代求解的聚类分析算法，其步骤是，预将数据分为K组，则随机选取K个对象作为初始的聚类中心，然后计算每个对象与各个种子聚类中心之间的距离，把每个对象分配给距离它最近的聚类中心。knn一般指邻近算法。

当 pip install 模块名 出现报错：pip._vendor.urllib3.exceptions.ReadTimeoutError: HTTPSConnectionPool(host='files.pythonhosted.org...如果是linux系统会区分python2还是python3，python3要用pip3。

使用下面代码解决if(!

这个命令的意思是：需要加载某包，先查找有没有下载过这个包，若不存在这个包，则运行的是直接一步安装并加载这个包，省去了先安装再加载的分步运行；若存在这个包，则运行的是加载这个包。这个命令的优点是：不会重复安装包，若脚本里写的是 install.packages("包名")，则会重复安装。require(包名))install.packages("包名")