热点综述 | 单细胞+空间转录组的整合分析方法总结

目前scRNA-seq将每个转录物与单个细胞相关联,但关于这些转录物在组织中的位置信息丢失了;相反的,空间转录组学技术知道转录物的位置,却不知道是哪个细胞产生了转录物。因此,scRNA-seq与空间转录组学的整合可以产生组织中细胞亚群的高分辨率图谱。

来自美国的科研人员在《Nature reviews genetics》发表综述文章,回顾了整合scRNA-seq与空间转录组学技术研究的尝试和努力,包括新兴的整合计算方法,并提出了有效结合当前方法的途径。

整合scRNA-seq和空间转录组学研究的流程模式

scRNA-seq+空间组学整合分析的研究进展

目前已有整合空间转录组学和scRNA-seq数据分析的研究,提供了组织组成和功能的新见解。下表展示了相关的研究现状,包括正常的组织稳态和发育、肿瘤微环境、其他病变和损伤的微环境等方向。

解析scRNA-seq和空间转录组数据的研究

scRNA-seq+空间组学整合分析的计算方法

  • 1
    点赞
  • 18
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值