热点综述 | 空间多组学技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用

目前空间多组学技术已用于研究几种类型癌症中肿瘤免疫微环境的转录组、蛋白质组和代谢组，从这些方法获得的数据已与免疫组化和多参数分析相结合，以产生癌症进展的标记物。2022年《Journal of Biomedical Science 》发表了一篇综述文章，回顾了前沿空间组学技术、它们在肿瘤免疫微环境研究中的应用，以及存在的技术挑战。

在过去十年中，单细胞技术揭示了肿瘤免疫微环境在基因组、转录组和蛋白质组水平上的异质性，加深了我们对肿瘤发展机制的理解。单细胞技术也被用于识别潜在的生物标志物。然而，这些方法丢失了有关肿瘤免疫微环境的空间信息，例如细胞位置和细胞间相互作用组。

早在空间组学发展之前，人们就知道肿瘤内的某些组织学模式与患者预后高度相关。例如，结直肠癌患者的瘤周T细胞和B细胞浸润与阳性预后相关，而肿瘤核心中淋巴细胞的耗竭是预后不良的指标。此外，T细胞的间质浸润与特定类型乳腺癌的良好预后有关。为了更好地了解与预后的空间相关性，研究人员使用多重免疫组织化学 (IHC)、免疫荧光 (IF) 和基于激光捕获显微切割的IHC/IF以及辅助工具来选择肿瘤区域，以分析蛋白质和RNA转录物的表达模式。这些类型的组织学分析受到分辨率和样本选择偏差相关问题的限制。最近在固相测序和多重成像方面的技术进步使得能够在高分辨率图像中多重检测转录本、蛋白质和代谢物。

 

空间多组学技术、分析工作流程和示例数据示意图

空间多组学技术

空间转录组技术

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