【华为OJ】DNA序列

描述:

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列

输入:一个string型基因序列,和int型子串的长度

输出:找出GC比例最高的字串

#include<iostream>
#include<string>

using namespace std;

int main()
{
	int n,ratio,count0=0,count,mark=0;
	string str;
	cin >> str;
	cin >> n;
	int len = str.size();
	for (int i = 0;i < n;i++)
	{
		if (str[i] == 'G' || str[i] == 'C')
			count0++;
	}
	for (int i = 0;i < len-n;i++)
	{
		count = 0;
		for (int j = i;j < i + n;j++)
		{
			if (str[j] == 'G' || str[j] == 'C')
				count++;
		}
		if (count > count0)
		{
			mark = i;count0 = count;
		}
	}
	for (int j = mark;j < mark + n;j++)
	{
		cout << str[j];
	}	
	return 0;
}

样例输入AACTGTGCACGACCTGA 5
样例输出GCACG


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