MPB | 扬大林淼组-​瘤胃混合细菌连续传代培养技术

b7c8f1b5beae506f8f179783e4396128.png

瘤胃混合细菌连续传代培养技术

Sequentially Transfer Ruminal Bacterial Cultures Technology in vitro

封丽梅,胡光辉,晏琦,林淼*

动物科学与技术学院,扬州大学,扬州,江苏省

*通讯作者邮箱:linmiao@yzu.edu.cn

引用格式:封丽梅, 胡光辉, 晏琦, 林淼. (2021). 瘤胃混合细菌连续传代培养技术. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003681. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003681.

How to cite: Yunyun Gao, Kai Peng, Defeng Bai, et al. 2024. The Microbiome Protocols eBook initiative: Building a bridge to microbiome research. iMeta 3: e182. https://doi.org/10.1002/imt2.182

摘要:反刍动物瘤胃是一个复杂的微生物共生生态系统,瘤胃中的微生物种类繁多、数量巨大,包括原虫(主要为纤毛虫)、细菌及部分厌氧真菌和少量侵害发酵有机体的噬菌体、病毒等,绝大部分属厌氧菌。瘤胃厌氧细菌不仅能够促进瘤胃的发酵,为宿主提供生命所需的能量、蛋白质、氨基酸和维生素等营养成分,还能够帮助反刍动物更好地利用纤维类饲料。因此,培养瘤胃混合细菌对提高饲料的消化利用率、降低饲料成本、扩大饲料原料的利用范围以及进一步促进畜牧业的发展具有重要意义。本实验是以饲料为发酵底物,在体外环境下对瘤胃混合细菌连续传代培养。此方法还可适用于分离纯化细菌,挖掘其功能。

关键词:瘤胃液,饲料,连续传代,细菌

材料与试剂

1.各种型号枪头

2.离心管 (2 mL、15 mL、50 mL)

3.锥形瓶 (500 mL)

4.容量瓶 (1 L)

5.量筒 (500 mL)

6.螺口瓶 (1 L)

7.注射器 (1 mL)

8.胶塞 (Bellco Glass Inc.,20 mm,2048-11800A)

9.厌氧培养瓶 (150 mL)

10.CaCl2·2H2O (国药集团化学试剂有限公司,中国,分析纯)

11.MnCl2·4H2O (国药集团化学试剂有限公司,中国,分析纯)

12.CoCl2·6H2O (天津市科密欧化学试剂有限公司,中国,分析纯)

13.FeCl3·6H2O (国药集团化学试剂有限公司,中国,分析纯)

14.NH4HCO3(天津市科密欧化学试剂有限公司,中国,分析纯)

15.NaHCO3(上海苏懿化学试剂有限公司,中国,分析纯)

16.Na2HPO4(天津市科密欧化学试剂有限公司,中国,分析纯)

17.KH2PO4(国药集团化学试剂有限公司,中国,分析纯)

18.MgSO4·7H2O (国药集团化学试剂有限公司,中国,分析纯)

19.Na2S·7H2O (国药集团化学试剂有限公司,中国,分析纯)

20.刃天青 (Solarbio,北京)

21.超纯水

22.人工培养缓冲液

仪器设备

1.恒温培养箱

2.磁力搅拌器

3.二氧化碳气罐及气体

4.气压测定计 (DPG1000B15PSIG-5,CeComp Electronics Inc.)

实验步骤

一、矿物盐缓冲液的制备

根据矿物盐缓冲液(配方见表1),分别配制A、B、C液,按照400 mL蒸馏水+0.1mL A液+200 mL B液+200 mL C液+1 mL 刃天青的比例混合各溶液,配制成矿物盐缓冲液,并持续通入无氧二氧化碳(纯度:99.9%以上),控制气体流速,有连续气泡流出即可。加入磁力转子(蒸馏水洗干净)在磁力搅拌器上搅拌,通气约3 h(pH=6.8±0.1)。A、B、C液经灭菌后可保存1个月(4℃),若不灭菌,现用现配。

二、发酵底物准备

将发酵底物(如植物性饲料)经65 °C干燥48 h后,粉碎过40目筛(0.42 mm粒径),密封备用。实验使用150 mL体积的厌氧培养瓶为培养装置,采集牛/羊瘤胃液(瘤胃液采集时间可根据试验目的来确定)前用小药勺称取发酵底物于干燥培养瓶中。为了保证测试样品具有代表性,每个样品至少做6个平行测定。

三、接种(林淼等,2020)

每只培养瓶加入15 mL缓冲液,并持续通入CO2(纯度:99.9%) 5 min,加入2.5 %硫化钠溶液0.15 mL后,胶塞密封,光照至缓冲液内的刃天青由蓝到粉直到褪至无色。瘤胃液来自带有永久性瘤胃瘘管的牛或羊,经4层无菌纱布过滤后,将容器灌满,立刻于39 °C水浴迅速带回实验室。每瓶加入2 mL瘤胃液,胶塞密封加铝盖后,测初始气压值。将培养瓶于39 °C静置培养。

四、传代

每72 h (根据实验目的可调整)传代一次,传代量为2 mL,其操作同“三、接种”。具体培养代数可根据试验目的选择。在每次传代后和72 h培养结束时,测定气压和发酵液pH值。收集发酵混合液。如为了研究细菌量的差异,可以在传代前和培养过程中根据试验目的留样测定细菌量。

溶液配方

矿物盐培养缓冲液(Menke, et al., 1979)配方见表1。

表1. 溶液配方

微量元素溶液 (A液):





氯化钙

CaCl2·2H2O

13.2 g


氯化锰

MnCl2·4H2O

10.0 g


氯化钴

CoCl2·6H2O

1.0 g


三氯化铁

FeCl3·6H2O

8.0 g


蒸馏水至


100 mL

缓冲溶液 (B液):






NH4HCO3

4.0 g



NaHCO3

35.0 g


蒸馏水至


1000 mL

常量元素溶液 (C液):






Na2HPO4

5.7 g



KH2PO4

6.2 g



MgSO4·7H2O

0.6 g


蒸馏水至


1000 mL

刃天青溶液:



0.1 % (w/v)

注:灭菌超纯水400 mL + A液0.1 mL + B液200 mL + C液200 mL + 刃天青溶液1 mL。配制A、B、C、刃天青、还原剂溶液的水需要无菌。使用前配制。

致谢

1.本研究得到了国家现代农业产业技术体系 (CARS-36),江苏省高校优势学科建设自主工程项目资助。

2.Lin, M., Dai X. X., Weimer P. J. (2019). Shifts in fermentation end products and bacterial community composition in long-term, sequentially transferred in vitro ruminal enrichment cultures fed switchgrass with and without ethanol as a co-substrate. Bioresource Technol 285: 121324.

参考文献

1.林淼,王阔鹏,陈映良,孙文婧,封丽梅,胡梓轩. (2020). 乙醇对瘤胃液接种稻秸的体外发酵产物及细菌群落结构的影响. 生物技术通报,36 (2):91-99.

2.Menke, K. H., Raab, L., Salewski, A., Schneider, W. (1979). The estimation of the digestibility and metabolizable energy content of ruminant feedingstuffs from the gas production when they are incubated with rumen liquor in vitro . J Agr Sci 93 (1): 217-222.

宏基因组推荐

本公众号现全面开放投稿,希望文章作者讲出自己的科研故事,分享论文的精华与亮点。投稿请联系小编(微信号:yongxinliu 或 meta-genomics)

猜你喜欢

iMeta高引文章 fastp 复杂热图 ggtree 绘图imageGP 网络iNAP
iMeta网页工具 代谢组MetOrigin 美吉云乳酸化预测DeepKla
iMeta综述 肠菌菌群 植物菌群 口腔菌群 蛋白质结构预测

10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature

系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树 必备技能:提问 搜索  Endnote

扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图

16S功能预测   PICRUSt  FAPROTAX  Bugbase Tax4Fun

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘  

写在后面

为鼓励读者交流快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”讨论群,己有国内外6000+ 科研人员加入。请添加主编微信meta-genomics带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。高级职称请注明身份,另有海内外微生物PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。

点击阅读原文

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值
>