字符串匹配算法

字符串匹配那些事(一)

本系列文章主要介绍几种常用的字符串比较算法,包括但不限于蛮力匹配算法,KMP算法,BM算法,Horspool算法,Sunday算法,fastsearch算法,KR算法等等。
本文主要介绍KMP算法和BM算法,它们分别是前缀匹配和后缀匹配的经典算法。所谓前缀匹配是指:模式串和母串的比较从左到右,模式串的移动也是从左到右;所谓后缀匹配是指:模式串和母串的的比较从右到左,模式串的移动从左到右。看得出来前缀匹配和后缀匹配的区别就仅仅在于比较的顺序不同。下文分别从最简单的前缀蛮力匹配算法和后缀蛮力匹配算法入手,详细的介绍KMP算法和BM算法以及它们的实现。

KMP算法

首先来看一下前缀蛮力匹配算法的代码(以下代码从linux源码string.h中抠出),模式串和母串的比较是从左到右进行(strncmp()),如果找不到和模式串相同的子串,则从左到右移动模式串,距离为1(s++)。

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char strstr ( register const char *s, register const char *wanted)
{
     register const size_t len = strlen (wanted);
     if (len == 0) return ( char *)s;
     while (*s != *wanted || strncmp (s, wanted, len))
         if (*s++ == '\0' )
             return ( char *)NULL;
     return ( char *)s;
}

KMP算法中的KMP分别是指三个人名:Knuth、Morris、Pratt,其本质也是前缀匹配算法,对比前缀蛮力匹配算法,区别在于它会动态调整每次模式串的移动距离,而不仅仅是加一,从而加快匹配过程。下图通过一个直观的例子展示前缀蛮力匹配算法和KMP算法的区别,前文提过,这二者唯一的不同在于模式串移动距离。

上图中,前缀蛮力匹配算法发现匹配不上,就向右移动距离1,而KMP算法根据已经比较过的前缀信息,了解到应该移动距离为2;换句话说针对母串的下一个匹配字符,KMP算法了解它下回应该匹配模式串的哪个位置,比如上图中,针对母串的第i+1个字符,KMP算法了解它应该匹配模式串的第k+1个字符。为什么会是这样,这是因为母串的子串T[i-k, i]=aba,而模式串的子串P[0,k]=aba,这二者正好相等。所以模式串应该移动到这个位置,从而让母串的第i+1个字符和模式串的第k+1个字符继续比较。

那k值又是如何寻找?请注意上图中,模式串位置j已经匹配上母串的位置i,也就是T[i-k, i] = P[j-k, j]=aba;根据前文的T[i-k, i] = P[0, k] = aba, 从而得出P[0, k] = P[j-k, j] = aba。通过观察发现,就是在模式的子串[0, j]中寻找一个最长前缀[0,k],从而使得[j-k, j] = [0,k];
于是可以定义一个jump数组,jump[j]=k,表示满足P[0, k] ==P[j-k, j] 的最大k值,或者表述为:如果模式串j+1匹配不上母串的i+1,那跳转到模式串k+1继续比较。有了这个jump数组,就很容易写出kmp算法的伪代码:

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j:=0;
for i:=1 to n do
Begin
    while (j>0) and (P[j+1]<>T[i]) do j:=jump[j];[
    if P[j+1]=T[i] then j:=j+1;
    if j=m then
    Begin
        writeln( 'Pattern occurs with shift ' ,i-m);
    end;
end;

KMP算法中jump数组的构建可以通过归纳法来解决,首先确定jump[1]=0;假设jump[j]=k,也就是P[0, k] == P[j-k, k],如果P[j+1] == P[k+1],那么得出[0,k+1] = P[j-k, j+1],从而更加定义得出jump[j+1] = k+1;
如果P[j+1] != P[k+1],那就接着比较P[j+1] ?= P[k1+1],其中(jump[k] = k1),根据(jump[k]=k1)的定义,P[0,k1] == P[k-k1, k],根据(jump[j]=k)的定义,P[0, k] == P[j-k, k],根据这两个等式,推出P[0, k1] == P[j-k1, j],如果此时P[j+1] == P[k1+1],则得出:jump[j+1] = K1 +1 = jump[k] +1。
如果P[j+1] != P[K1+1],继续递归比较P[j+1] 和P[jump[jump[k]]+1]  ….  P[1];
如果依次比较都不相等,那么jump[j+1] = 0;写成伪代码如下,可以看出其实就是模式串自我匹配的过程。

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jump[1]:=0;
j:=0;
for i:=2 to m do
begin
     while (j>0) and (P[j+1]<>P[i]) do j:=jump[j];
     if P[j+1]=P[i] then  j:=j+1;
     jump[i]:=j;
end;

考虑模式串匹配不上母串的最坏情况,前缀蛮力匹配算法的时间复杂度最差是O(n×m),最好是O(n),其中n为母串的长度,m为模式串的长度。KMP算法最差的时间复杂度是O(n);最好的时间复杂度是O(n/m)。

BM算法

后缀匹配,是指模式串的比较从右到左,模式串的移动也是从左到右的匹配过程,经典的BM算法其实是对后缀蛮力匹配算法的改进。所以还是先从最简单的后缀蛮力匹配算法开始。下面直接给出伪代码,注意这一行代码:j++;BM算法所做的唯一的事情就是改进了这行代码,即模式串不是每次移动一步,而是根据已经匹配的后缀信息,从而移动更多的距离。

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j = 0;
while (j <= strlen (T) - strlen (P)) {
    for (i = strlen (P) - 1; i >= 0 && P[i] ==T[i + j]; --i)
    if (i < 0)
       match;
    else
       ++j;
}

为了实现更快移动模式串,BM算法定义了两个规则,好后缀规则和坏字符规则,如下图可以清晰的看出他们的含义。利用好后缀和坏字符可以大大加快模式串的移动距离,不是简单的++j,而是j+=max (shift(好后缀), shift(坏字符))

先来看如何根据坏字符来移动模式串,shift(坏字符)分为两种情况:

  • 坏字符没出现在模式串中,这时可以把模式串移动到坏字符的下一个字符,继续比较,如下图:

  • 坏字符出现在模式串中,这时可以把模式串第一个出现的坏字符和母串的坏字符对齐,当然,这样可能造成模式串倒退移动,如下图:


为了用代码来描述上述的两种情况,设计一个数组bmBc['k'],表示坏字符‘k’在模式串中出现的位置距离模式串末尾的最大长度,那么当遇到坏字符的时候,模式串可以移动距离为: shift(坏字符) = bmBc[T[i]]-(m-1-i)。如下图:

数组bmBc的创建非常简单,直接贴出代码如下:

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void preBmBc( char *x, int m, int bmBc[]) {
     int i;
     for (i = 0; i &lt; ASIZE; ++i)
          bmBc[i] = m;
     for (i = 0; i &lt; m - 1; ++i)
          bmBc[x[i]] = m - i - 1;
}

再来看如何根据好后缀规则移动模式串,shift(好后缀)分为三种情况:

  • 模式串中有子串匹配上好后缀,此时移动模式串,让该子串和好后缀对齐即可,如果超过一个子串匹配上好后缀,则选择最靠左边的子串对齐。

  • 模式串中没有子串匹配上后后缀,此时需要寻找模式串的一个最长前缀,并让该前缀等于好后缀的后缀,寻找到该前缀后,让该前缀和好后缀对齐即可。

  • 模式串中没有子串匹配上后后缀,并且在模式串中找不到最长前缀,让该前缀等于好后缀的后缀。此时,直接移动模式到好后缀的下一个字符。

为了实现好后缀规则,需要定义一个数组suffix[],其中suffix[i] = s 表示以i为边界,与模式串后缀匹配的最大长度,如下图所示,用公式可以描述:满足P[i-s, i] == P[m-s, m]的最大长度s。

构建suffix数组的代码如下:

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suffix[m-1]=m;
for (i=m-2;i>=0;--i){
     q=i;
     while (q>=0&&P[q]==P[m-1-i+q])
         --q;
     suffix[i]=i-q;
}

有了suffix数组,就可以定义bmGs[]数组,bmGs[i] 表示遇到好后缀时,模式串应该移动的距离,其中i表示好后缀前面一个字符的位置(也就是坏字符的位置),构建bmGs数组分为三种情况,分别对应上述的移动模式串的三种情况

  • 模式串中有子串匹配上好后缀

  • 模式串中没有子串匹配上好后缀,但找到一个最大前缀

  • 模式串中没有子串匹配上好后缀,但找不到一个最大前缀

构建bmGs数组的代码如下:

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void preBmGs( char *x, int m, int bmGs[]) {
    int i, j, suff[XSIZE];
    suffixes(x, m, suff);
    for (i = 0; i < m; ++i)
       bmGs[i] = m;
    j = 0;
    for (i = m - 1; i >= 0; --i)
       if (suff[i] == i + 1)
          for (; j < m - 1 - i; ++j)
             if (bmGs[j] == m)
                bmGs[j] = m - 1 - i;
    for (i = 0; i <= m - 2; ++i)
       bmGs[m - 1 - suff[i]] = m - 1 - i;
}

再来重写一遍BM算法:

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j = 0;
while (j <= strlen (T) - strlen (P)) {
    for (i = strlen (P) - 1; i >= 0 && P[i] ==T[i + j]; --i)
    if (i < 0)
       match;
    else
       j += max(bmGs[i], bmBc[T[i]]-(m-1-i));
}

考虑模式串匹配不上母串的最坏情况,后缀蛮力匹配算法的时间复杂度最差是O(n×m),最好是O(n),其中n为母串的长度,m为模式串的长度。BM算法时间复杂度最好是O(n/(m+1)),最差是多少?留给读者思考。

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