R语言做统计检验绘图如何添加p-value和显著性标记？——详细介绍如何通过ggpubr包为ggplot图添加p-value以及显著性标记？

最新推荐文章于 2024-02-01 09:23:33 发布

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分类专栏：数据分析统计学机器学习文章标签：可视化机器学习

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本文详细介绍了如何使用R语言的ggpubr包为ggplot图添加p-value和显著性标记。通过比较方法、compare_means()和stat_compare_means()函数，展示了如何在箱线图、条形图、线图等图形中添加这些信息，包括独立两组、配对样本、多组比较和多组变量的情况。示例中使用了ToothGrowth数据集和其他数据集进行操作演示。

摘要由CSDN通过智能技术生成

本文转载于：https://zhuanlan.zhihu.com/p/33209557

在R语言在生物信息学的实际应用中，常常需要添加p-value和显著性标记。很多同学对于添加P-value这个问题一直一知半解，殊不知，不同的类型添加P-value选择的方法也是不同的。

在这里插入图片描述

本文将详细介绍如何通过ggpubr包为ggplot图添加p-value以及显著性标记。利用数据集ToothGrowth进行演示。

#先加载包
library(ggpubr)
#加载数据集ToothGrowth
data("ToothGrowth")
head(ToothGrowth)

## len supp dose
## 1 4.2 VC 0.5
## 2 11.5 VC 0.5
## 3 7.3 VC 0.5
## 4 5.8 VC 0.5
## 5 6.4 VC 0.5
## 6 10.0 VC 0.5