分析背景
火山图常用于转录组研究中,也能应用于基因组,蛋白质组,代谢组等统计数据。它归根到底是是散点图的一种,它能将统计学中的统计显著性量度(如p value,矫正后的P值)和变化幅度相结合,从而能够帮助人们识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据(如基因,蛋白等),如下图所示。
图形分解
- 图中每一点代表所研究的基因,灰色的点代表这些基因在实验组和对照组的表达情况不具有差异性,绿色和红色的点代表上调基因和下调基因。
- 横坐标log2FC代表差异倍数,离坐标原点越远,说明差异倍数越大
- 纵坐标-log10(PValue)代表差异结果的显著性,越往上的点,说明差异结果越显著。
- 图1B与图1A向比较,图1B将实验组和对照组中差异倍数最大的前二十个基因的名称在图中展示出来,包括十个上调基因和十个下调基因,当然在后面小编将教小伙伴们如何将感兴趣的基因(如:抑癌基因,管家基因,促癌基因)展示在图上中。
函数式编程的优势
- 与零碎的代码相比,反复调用,参数简单易学,对初学者更加友好。
- 与网页绘图小工具相比,不要要注册,不需要付费,方面经济。
- 对有经验的程序员,函数式编程能够提高程序员的编程水平,减少代码的重复