Ribo-seq数据分析:比对流程详解
1. 前言
Ribo-seq(Ribosome Profiling)是一种研究翻译组学的重要技术,通过捕获核糖体保护的mRNA片段来研究翻译过程。之前介绍了质控部分,本文将继续介绍Ribo-seq数据的比对流程,包括基因组预处理、比对和统计分析的完整步骤。
2. 环境准备
2.1 软件安装
conda create -n riboseq python=3.8
conda activate riboseq
conda install -c bioconda star samt