1264: [AHOI2006]基因匹配Match
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Description
基因匹配(match)卡卡昨天晚上做梦梦见他和可可来到了另外一个星球,这个星球上生物的DNA序列由无数种碱基排列而成(地球上只有4种),而更奇怪的是,组成DNA序列的每一种碱基在该序列中正好出现5次!这样如果一个DNA序列有N种不同的碱基构成,那么它的长度一定是5N。卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦,而可可这些日子正在研究生物信息学中的基因匹配问题,于是他决定为这个奇怪星球上的生物写一个简单的DNA匹配程序。 为了描述基因匹配的原理,我们需要先定义子序列的概念:若从一个DNA序列(字符串)s中任意抽取一些碱基(字符),将它们仍按在s中的顺序排列成一个新串u,则称u是s的一个子序列。对于两个DNA序列s1和s2,如果存在一个序列u同时成为s1和s2的子序列,则称u是s1和s2的公共子序列。卡卡已知两个DNA序列s1和s2,求s1和s2的最大匹配就是指s1和s2最长公共子序列的长度。 [任务] 编写一个程序: 从输入文件中读入两个等长的DNA序列; 计算它们的最大匹配; 向输出文件打印你得到的结果。
Input
输入文件中第一行有一个整数N,表示这个星球上某种生物使用了N种不同的碱基,以后将它们编号为1…N的整数。以下还有两行,每行描述一个DNA序列:包含5N个1…N的整数,且每一个整数在对应的序列中正好出现5次。
Output
输出文件中只有一个整数,即两个DNA序列的最大匹配数目。
Sample Input
2
1 1 2 2 1 1 2 1 2 2
1 2 2 2 1 1 2 2 1 1
1 1 2 2 1 1 2 1 2 2
1 2 2 2 1 1 2 2 1 1
Sample Output
7
HINT
[数据约束和评分方法]
60%的测试数据中:1<=N <= 1 000
100%的测试数据中:1<=N <= 20 000
Source
pos存在a中的位置
每遇到一个b找最大值
#include<iostream>
#include<cstring>
#include<cstdio>
using namespace std;
const int N = 1000000 + 5;
int a[N],b[N],pos[N][6],n,c[N],f[N],ans;
void update( int x, int y ){
for( int i = x; i <= n*5; i += i&(-i) ) c[i] = max(c[i],y);
}
int find( int x ){
int re=0;
for( int i = x; i; i -= i&(-i)) re = max(re,c[i]);
return re;
}
int main(){
scanf("%d", &n);
for( int i = 1; i <= n*5; i++ ){
scanf("%d", &a[i]);
pos[a[i]][++pos[a[i]][0]] = i;
}
for( int i = 1; i <= n*5; i++ ) scanf("%d", &b[i]);
for( int i = 1; i <= n*5; i++ )
for( int j = 5; j; j-- ){
int x = pos[b[i]][j];
f[x] = max(f[x],find(x-1)+1);
update(x,f[x]);
ans = max(ans,f[x]);
}
printf("%d", ans); return 0;
}