[bzoj1264][AHOI2006]基因匹配Match 树状数组优化dp

1264: [AHOI2006]基因匹配Match

Time Limit: 10 Sec  Memory Limit: 162 MB
[ Submit][ Status][ Discuss]

Description

基因匹配（match）卡卡昨天晚上做梦梦见他和可可来到了另外一个星球，这个星球上生物的DNA序列由无数种碱基排列而成（地球上只有4种），而更奇怪的是，组成DNA序列的每一种碱基在该序列中正好出现5次！这样如果一个DNA序列有N种不同的碱基构成，那么它的长度一定是5N。卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦，而可可这些日子正在研究生物信息学中的基因匹配问题，于是他决定为这个奇怪星球上的生物写一个简单的DNA匹配程序。 为了描述基因匹配的原理，我们需要先定义子序列的概念：若从一个DNA序列（字符串）s中任意抽取一些碱基（字符），将它们仍按在s中的顺序排列成一个新串u，则称u是s的一个子序列。对于两个DNA序列s1和s2，如果存在一个序列u同时成为s1和s2的子序列，则称u是s1和s2的公共子序列。卡卡已知两个DNA序列s1和s2，求s1和s2的最大匹配就是指s1和s2最长公共子序列的长度。 [任务] 编写一个程序： 从输入文件中读入两个等长的DNA序列； 计算它们的最大匹配； 向输出文件打印你得到的结果。

Input

输入文件中第一行有一个整数N，表示这个星球上某种生物使用了N种不同的碱基，以后将它们编号为1…N的整数。以下还有两行，每行描述一个DNA序列：包含5N个1…N的整数，且每一个整数在对应的序列中正好出现5次。

Output

输出文件中只有一个整数，即两个DNA序列的最大匹配数目。

Sample Input

2
1 1 2 2 1 1 2 1 2 2
1 2 2 2 1 1 2 2 1 1

Sample Output

7

HINT

[数据约束和评分方法]
60%的测试数据中：1<=N <= 1 000
100%的测试数据中：1<=N <= 20 000

Source

pos存在a中的位置

每遇到一个b找最大值

#include<iostream>
#include<cstring>
#include<cstdio>
using namespace std;
const int N = 1000000 + 5;
int a[N],b[N],pos[N][6],n,c[N],f[N],ans;
void update( int x, int y ){
	for( int i = x; i <= n*5; i += i&(-i) ) c[i] = max(c[i],y);
}
int find( int x ){
	int re=0;
	for( int i = x; i; i -= i&(-i)) re = max(re,c[i]);
	return re;
}
int main(){
	scanf("%d", &n);
	for( int i = 1; i <= n*5; i++ ){
		scanf("%d", &a[i]);
		pos[a[i]][++pos[a[i]][0]] = i;
	}
	for( int i = 1; i <= n*5; i++ ) scanf("%d", &b[i]);
	for( int i = 1; i <= n*5; i++ )
		for( int j = 5; j; j-- ){
			int x = pos[b[i]][j];
			f[x] = max(f[x],find(x-1)+1);
			update(x,f[x]);
			ans = max(ans,f[x]);
		}
	printf("%d", ans); return 0;
}