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原创 绘图网站工具

词云韦恩图(1) https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/

2020-09-06 20:49:00 312

原创 Python 中 print() 打印多行变量

n = 123f = 456.789s1 = 'Hello, world's2 = 'Hello, \'Adam\''s3 = r'Hello, "Bart"'s4 = r'''Hello,Lisa!'''print(n,f,s1,s2,s3,s4,sep='\n')输出结果为:

2020-05-17 14:56:23 8773

原创 R中的for循环

例一a <- 0for (i in seq(1:283)){ if (as.character(test_data$class)[i] == test_data$predict_2[i]) a = a +1}格式:for (i in ()) {}在R中生成一个连续序列使用的函数是seq(1:n)例二test <- NAfor (i in 1:15){ test[i] <- data[i,1]/mean[i]}或者直接使用 for (i

2020-05-16 18:35:09 6705

原创 R中利用 apply() 将数据框中 factor 类型变量改为数值型

举个例子library(mlbench)data(BreastCancer)str(BreastCancer)此时输出为:BreastCancer1 <- apply(BreastCancer[,2:10],2,as.numeric) # 将2-10列的数据变成数值型BreastCancer <- data.frame(BreastCancer1, BreastCancer[,11]) names(BreastCancer)[names(BreastCance

2020-05-16 10:13:04 10725 2

原创 R 中导入csv数据,编辑数据框中异常值并绘制箱线图 Boxplot

1. 打开Rstudio2. 使用 read.csv() 读取数据。例如:g <- read.csv(“homework3-4_data.csv”)3. 执行下述代码绘制箱线图。boxplot(g[,-1])可以看到箱线图里面有许多异常值,但是并不是每一个异常值都没有意义。我们仅仅需要去掉红色圈住的两个异常值。可进行如下操作来实现。4. 编辑数据框g1 = edit(g)...

2020-04-08 19:54:49 2961

原创 R 中箱线图 Boxplot 去除异常值的操作

打开 Rstudio.使用 read.table() 读取数据。例如:G <- read.table(“homework3-4_data.csv”, header = TRUE, sep = “,”)使用下述命令绘制箱线图。boxplot(G)但是可在图中看出是有异常值的,若要去掉异常值可进行下述操作。执行下述命令boxplot(G[,-1], outline = F)...

2020-04-07 20:50:17 23815 6

原创 R 中箱线图 Boxplot 对数据特定列数进行作图的技巧

打开Rstudio.使用 read.table() 读取数据。例如:G <- read.table(“homework3-4_data.csv”, header = TRUE, sep = “,”)使用下述命令绘制箱线图。boxplot(G)实际上第一列并没有意义,作图时可能希望把第一列剔除。可通过下列方法进行操作。使用下述命令,剔除第一列进行作图。boxplot(G[,-1...

2020-04-07 20:40:58 5896

原创 Pymol中如何保持蛋白部分残基不动,移动另一部分残基。

这里以移动蛋白分子中的一个残基为例,如果要移动较多残基的话只需要选中多个残基即可。任意打开一个 pdb 文件,show as lines。点击 Pymol 右下角 S 显示蛋白残基序列。在这里为了方便演示,就 copy 一个残基来说明操作方法。任意选中一个残基 -> A -> copy to object。右键点击 Pymol 右下角。选择 editing 编辑模式。选...

2020-03-28 17:25:41 7709 1

原创 Markdown 中将无效超链接由链接形式转换为纯文本格式方法

例如 Markdown 中编辑为:显示为超链接形式若要将该链接显示为文本形式,在 Markdown 中做如下编辑:则可显示为:推荐一个Markdown线上编辑器:https://www.mdeditor.com/...

2020-03-27 16:11:06 3093 1

原创 Endnote中批量导入本地文献方法

Endnote中批量导入本地文献方法Endnote版本是EndnoteX9先将要导入的文献放在一个本地文件夹下打开Endnote,Files->import->folder点击choose,打开文献所在的本地文件夹,其中下方有两个选项,Include files in subfolders(将该文件夹下所有包括子文件夹及内容也导入)和Creat a Group Set fo...

2020-03-26 15:54:06 36706 3

空空如也

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