因为做生物信息工作需要这个包去计算化学结构的相似性,所以就安装了这个工具包。安装过程中有一点小坑,在这里写出来供大家参考。
首先介绍一下,RDkit 是一款开源化学信息学与机器学习工具包,提供C++ 和python 的API 接口,因此可以使用这个包用python进行化学上的计算。
安装一定要使用anconda环境,我也用过python环境去装结果不行。IDE使用的是pycharm,在pycharm的环境下建立虚拟conda环境,对于玩儿pycharm的同学来说肯定很熟悉了。
然后使用terminal安装代码如下:
在已有的conda环境中安装rdkit
conda install rdkit
如不成功请用下面一个命令:
conda install -c conda-forge rdkit