Oliver-nana-CSDN博客

原创解决 /lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.18‘ not found以及glibc安装错误error: you must configure in a separat

2.1前提：参考博客以下博客解决无果：1.解决类似 /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21’ not found 的问题https://itbilu.com/linux/management/NymXRUieg.html2./lib64/libstdc++.so.6: version`GLIBCXX_3.4.20’ not found问题解决方法https://blog.csdn.net/GUI1259802368/article/de

2020-07-12 00:36:11 5339

原创 error while loading shared libraries: libstdc++.so.6: cannot open shared object file: No such fill

解决缺少libstdc++.so.6库的原因及解决办法error while loading sharedlibraries: libstdc++.so.6: cannot open shared object file: No such file ordirectory1.1先加载所有安装包yum repolist1.2查看哪个安装包包含该库：yum provides libstdc++.so.6输出可以看到：可以看到安装包libstdc+±4.8.5-39.el7.i6861..

2020-07-12 00:33:20 16256 3

原创解决报错‘version `GLIBCXX_3.4.20‘ not found’

报错：运行时程序时出现了以下错误：version `GLIBCXX_3.4.20' not found (required by node)version `GLIBCXX_3.4.21' not found (required by node)运行以下命令检查动态库：strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBC部分输出如下：GLIBCXX_3.4GLIBCXX_3.4.1GLIBCXX_3.4.2GLIBCXX_3..

2020-07-11 20:47:58 26559 2

原创生信中常用的linux命令01

#文本编辑命令rm(删除文件夹/文件) ls(查看文件目录)ls -a(查看所有文件包括隐藏)ll(列出所有文件包括权限等内容)#新建文件,打开winscp并刷新后可看到touch example.txt#删除文件rm example.txt#备份文件cp .原文件 .备份文件例：备份.bashrc文件为.bashrc.2cp .bashrc .bashrc.2#...

2020-04-15 15:56:25 279

原创生信平台搭建之用xshell连接ubuntu

#一、前期准备：01、安装Oracle VM VirtualBox、Ubuntu 以及Xshell02、设置Oracle VM VirtualBox、Ubuntu的基本参数03、打开Xshell，点击有绿色十字标记的新建，如下图所示04、新建会话后出现如下页面，需要在主机一栏里输入ip二、Oracle VM VirtualBox的操作部分：01、从Oracle VM Virtual...

2020-04-14 23:49:53 449 1

原创肝癌案例之使用TCGAbiolinks 包查询并下载数据_01

#install packageif (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("TCGAbiolinks")librar...

2020-04-12 19:25:27 1329

原创 R语言_数组学习笔记

#01A、创建数组#在R中，一般用array()函数来创建数组。array(data = NA, dim = length(data), dimnames = NULL)，其中：data给定数组元素，默认情况下是NA；dim用来指定数组的维度，默认情况下是一维数组；dimnames设定各维度的名称，必须是个列表，默认情况下无名称。#1.1 2x3x4的三维数组（2行3列4块），元素为1到24的...

2020-04-08 20:13:45 528

原创使用TCGAbiolinks查询与下载TCGA数据

#install packageif (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("TCGAbiolinks")librar...

2020-04-08 14:36:08 2125 1

原创使用GDC API查询与下载数据

#以UUID为d853e541-f16a-4345-9f00-88e03c2dc0bc为例#01使用GDC API查询数据#教程网址：https://docs.gdc.cancer.gov/API/Users_Guide/Search_and_Retrieval/#1.1等效链接：https://api.gdc.cancer.gov/files/d853e541-f16a-4345-9f00...

2020-04-06 23:32:12 687

原创使用gdc-client下载数据

01、下载与安装Data Transfer Tool1.1 软件下载地址：https://docs.gdc.cancer.gov/Data_Transfer_Tool/Users_Guide/Getting_Started/#downloading-the-gdc-data-transfer-tool1.2 得到压缩文件后减压，得到gdc-client.exe，注意将gdc-client.e...

2020-04-04 23:18:10 3596 3

原创用biopython解析序列

#01 读取常见的序列文件格式（fasta，gb）from Bio import SeqIO# 读取包含单个序列 Fasta 格式文件fa_seq = SeqIO.read("bio and python练习/sequence01.fasta", "fasta")print(fa_seq)print('\n')# 逐行读取包含多个序列的 fasta 格式文件for fa in Se...

2020-04-02 18:39:01 1452

原创 python生物信息学数据管理_02第一个python程序

#2.2计算胰岛素序列中的氨基酸频率#2.2.2python会话示例# insulin [Homo sapiensl GI:386828# axtracted 51 amino acids of A+B chaininsulin = 'GlVEQCCTSICSLYQLENYCNFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKT'for amino_acid in "ACDEF...

2020-03-31 22:45:59 666

原创 pip安装biopython

前提是我已经安装了Anaconda，并将其所属文件夹命名为Anaconda2，详解链接：https://editor.csdn.net/md/?articleId=95532522。pip安装biopython的步骤如下：1、法1：点运行，输入cmd进入终端，输入d:，cd, Anaconda2\Scripts (biopython的安装路径）；法2：在文件中找到Anaconda2目录下的S...

2020-03-31 22:03:22 1409

原创完成基因序列（fasta格式）的提取，核苷酸计数，GC含量计算，DNA 翻译为 RNA，RNA 翻译为蛋白质，反向序列获取的相关函数

from __future__ import division#这是计算gc含量需要的模块，需要在首行导入，否则会报错import re#04_3 DNA 翻译为 RNA时会用得着#01打开下载的文件with open('sequence01.fasta') as file: for line in file: print (line)#02把描述字段和序列分...

2020-03-30 23:06:01 2755 3

原创用穷举算法进行规划求解

#partA：采用穷举法进行规划求解的基本算法for a in range(0, 2): for b in range(0, 2): for c in range(0, 2): for d in range(0,2): if a * 6 + b * 4 + c * 5+ d * 8==15: ...

2019-09-28 20:50:59 791 1

原创解决python - NameError: name 'imshow' is not defined.

#原来的代码import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npfrom numpy import array#从numpy导入array数组模块from numpy import zeroslist_1 = [ [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, ...

2019-09-26 22:15:14 10582 1

原创基于数组绘制❤战的灰度图像

#基于数组绘制❤战的灰度图像#以下导入的模块中，有的模块是多余的from pylab import *import numpy as npimport pandas as pdfrom pandas import Series, DataFrameimport csvimport jsonimport requestsimport sqlite3import sqlalch...

2019-09-26 22:07:56 147

原创最简像素体验之绘出“❤战”，为肖战应援

代码如下：**data1 = [[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0], [1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1], [0,...

2019-09-21 01:49:06 742 1

原创 pip安装pygal

1、点运行，输入cmd进入终端，输入d:，cd, Anaconda2\Scripts (pygal的安装路径）；2、输入：pip install pygal==2.4.03、输入：pip show pygal,若输出Version： 2.4.0之类的内容，则表明pygal安装成功。...

2019-07-22 01:56:02 1192

原创对连接到路由器的用户进行限速

终端输入： tracert -d ip或域名；在浏览器打开输出的第一个ip；可以看到连到路由器的设备和ip,并可对其进行限速等操作。

2019-07-18 22:00:27 316

原创通过selenium webdriver调用google chrome

#安装selenium、测试selenium是否安装成功1、测试Anaconda是否安装成功复制本人的安装Anaconda的路径（D:\Anaconda2\Scripts）；点运行，cmd；d:;cd , Anaconda2\Scripts；conda --version；若输出conda 4.7.5之类的就说明环境变量设置成功了。作者：Oliver-nana来源：CSDN原...

2019-07-13 12:39:49 619 1

原创 #Anaconda下载安装、环境配置与解决Pycharm导入requests后报错的问题

Anaconda下载安装、环境配置与解决Pycharm导入requests后报错的问题第一部分: Anaconda下载安装、环境配置**#**Anacond下载下载地址：https://www.anaconda.com/distribution/#download-section；我下载的是python3.7 ；64bit ；662mb**#**安装 Anaconda后面的对话框中记得...

2019-07-11 22:57:45 2980

zhangyingna667的博客