LexEVS 6.x安装教程Centos版

下载LexEVS 6.5.0  https://cbiit-download.nci.nih.gov/evs/LexEVS/v6.5/Release/LexEVS-install-6.5.0.FINAL.jar

创建数据库：CREATE DATABASE {数据库名} CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci;

安装jdk1.8.0_144-2000:1.8.0_144-fcs.x86_64

wget http://219.238.4.228/files/5009000005CDA520/download.oracle.com/otn-pub/java/jdk/8u144-b01/090f390dda5b47b9b721c7dfaa008135/jdk-8u144-linux-x64.rpm
rpm -ivh jdk-8u144-linux-x64.rpm
rpm -Uvh jdk-8u144-linux-x64.rpm

在vim /etc/profile 文件里写下如下配置：

JAVA_HOME=/usr/java/jdk1.8.0_144/
PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
export JAVA_HOME
export PATH
export CLASSPATH

在图形模式下运行 java -jar LexEVS-install-6.5.0.FINAL.jar 安装

http://repo1.maven.org/maven2/mysql/mysql-connector-java/5.1.6/mysql-connector-java-5.1.6.jar 下载到/usr/local/LexGrid/LexEVS/6.5.0.FINAL/runtime/sqlDrivers目录

vi /usr/local/LexGrid/LexEVS/6.5.0.FINAL/resources/config/lbconfig.props 修改配置文件如下内容：

#DB_URL=jdbc:mysql://server.url/lexevs 改为 DB_URL=jdbc:mysql://localhost:3306/lexevs

#DB_DRIVER=com.mysql.jdbc.Driver  这句去掉前面的#

DB_USER=root
DB_PASSWORD=密码

安装URI_Resolver-1.0.0步骤：

git clone https://github.com/NCIP/URI_Resolver.git

安装NetBeans IDE环境并以打开项目的方式加载URI_Resolver文件夹

在项目里的其他源src\main\resources打开uriresolver.properties文件，修改为：

db.driverClassName=com.mysql.jdbc.Driver

db.url=jdbc:mysql://localhost:3306/uriresolver

db.username=uriuser

db.password=uriuser

db.editable=true

log.level=3

log.filelocation=

user.properties文件增加用户：

cts2 mayo+nih
cts abc123

在NetBeans里右键点击URI_Resolver项目选择清理并构建
找到URI_Resolver/target/URI_Resolver-1.0.0.war文件复制到tomcat下webapps目录，例如：

cp /Code/URI_Resolver/target/URI_Resolver-1.0.0.war /Code/apache-tomcat-9.0.0.M26/webapps/
/Code/apache-tomcat-9.0.0.M26/bin/startup.sh

安装MySQL 5.7并创建uriresolver数据库，然后重新配置MySQL，密码规则：

select @@validate_password_length;
set global validate_password_length=1;
set global validate_password_mixed_case_count=2;
flush privileges;

CREATE USER 'uriuser'@'localhost' IDENTIFIED BY 'uriuser';

将src\main\resources\uriresolver.sql导入uriresolver数据库