1.DNA序列

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

参考代码:

#include <iostream>
#include <string>
using namespace std;
double Ratio(string a)
{
	int num=0;
	for (int i=0;i<a.size();i++)
		if (a[i]=='G'||a[i]=='C')
			num++;
	return (double)num/(double)a.size();
}
int main()
{
	string s;
	int len,start;
	double max=0;
	cin>>s;
	cin>>len;
	if (len>=s.size() ||len<2||s.size()==0)
		return -1;
	for (int i=0;i+len<s.size();i++)
	{
		string str=s.substr(i,len);
		if (Ratio(str)>max)
		{
			max=Ratio(str);
			start=i;
		}
	}
	cout<<s.substr(start,len)<<endl;
}


 

  • 1
    点赞
  • 2
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 1
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值