2019年12月_脑机接口社区

原创常见采集脑电信号的四种技术

目录脑电图(Electroencephalography,EEG)皮层脑电图（Electrocorticography, ECoG）深度电极(Depth electrode)功能磁共振成像(FunctionalMagnetic Resonance Imaging, fMRI)文章来源：常见采集脑电信号的四种技术脑机接口(BCI)是可以不间断地进行通信或控制的设备。BCI检测到用户大脑活动的特定...

2019-12-30 21:48:44 7729 1

原创 Python-EEG工具库MNE中文教程(14)-Epoch对象中的元数据(metadata)

目录本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195本案例演示使用Epochs元数据。关于Epochs数据结构:可以查看文章Python-EEG工具库MNE中文教程(2)-MNE中数据结构Epoch及其创建方法和Python-EEG工具库MNE中文教程(3)-MNE中数据结构Epoch及其用法简介有时候使用mn...

2019-12-27 20:34:41 1511 1

原创 Nilearn教程系列(4)-脑部地图集绘制

目录脑部地图集绘制第一步：下载数据集第二步：可视化Harvard-Oxford 脑部地图集玻璃脑图(Glass brain)绘制本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195脑部地图集绘制数据集来源：Harvard-Oxford 脑部地图集第一步：下载数据集数据集文件格式为:HarvardOxford-...

2019-12-26 19:12:30 2573 1

原创 Python-EEG工具库MNE中文教程(13)-“bad“通道介绍

目录标记坏频道/标记不良通道(marking bad channels)本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195本教程主要介绍手动标记坏通道以及基于其他传感器的好信号重建"bad"通道。导入工具库import osfrom copy import deepcopyimport numpy as n...

2019-12-25 20:57:40 3078

原创 EEGNet: 深度学习应用于脑电信号特征提取

目录简介EEGNet网络原理EEGNet网络实现本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195简介脑机接口（BCI）使用神经活动作为控制信号，实现与计算机的直接通信。这种神经信号通常是从各种研究透彻的脑电图(EEG)信号中挑选出来的。卷积神经网络（CNN）主要用来自动特征提取和分类，其在计算机视觉和语音识别领...

2019-12-24 18:51:13 10979 5

原创 Nilearn中的Matplotlib颜色图

本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195可视化Nilearn附带的HCP connectome工作台颜色图，可用于在表面上绘制大脑图像。import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltfrom nilearn.plotting.cm import _...

2019-12-23 21:15:33 540

原创大脑布罗德曼分区系统简介

目录布罗德曼分区是一个根据细胞结构将大脑皮层划分为一系列解剖区域的系统。神经解剖学中所谓细胞结构（Cytoarchitecture），是指在染色的脑组织中观察到的神经元的组织方式。布罗德曼分区最早由德国神经科医生科比尼安·布洛德曼（Korbinian Brodmann）提出。他的分区系统包括每个半球的52个区域。其中一些区域今天已经被细分，例如23区被分为23a和23b区等。从物种间差异来讲，...

2019-12-23 20:48:43 5228 1

原创 Python-EEG工具库MNE中文教程(12)-注释连续数据

目录注释连续数据(Annotating continuous data)通过代码创建注释可视化原始对象交互式注释原始对象对注释对象的操作本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195注释连续数据(Annotating continuous data)本案例主要介绍如何向原始(Raw)对象添加注释，以及在数据处...

2019-12-21 21:41:46 1508

原创 Python-EEG工具库MNE中文教程(11)-信号空间投影SSP 应用

目录信号空间投影（SSP）MNE Python中的投影(projector)1.导入工具库2.加载数据3.计算投影4.加载和保存投影5.添加和移除投影本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195信号空间投影（SSP）在前面一篇分享信号空间投影SSP数学原理中提到，投影矩阵将根据您试图投射出的噪声种类而变化。...

2019-12-19 18:46:29 1508

原创脑与神经类开放数据库汇总

1000 Functional Connectomes Project最为著名的脑与神经数据库之一http://fcon_1000.projects.nitrc.org/fcpClassic/FcpTable.htmlADNI提供与阿尔茨海默疾病相关的各种数据http://adni.loni.usc.edu/Allen Brain Atlas:艾伦脑图谱http://www.brai...

2019-12-18 18:52:03 2231

原创 Python-EEG工具库MNE中文教程(10)-信号空间投影SSP数学原理

目录projector(投影)和投影背景案例解释投影原理导入工具库什么是projector(投影)？计算正交平面使用SVD计算投影矩阵本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195projector(投影)和投影背景projector(投影)（简称proj），也称为信号空间投影（SSP），定义了应用于空间上的...

2019-12-17 21:51:52 1713

原创 Nilearn教程系列(3)-ICA静息功能磁共振成像的分组分析:CanICA

目录简介案例1.加载ADHD200数据2.将CanICA应用在核磁共振图像3.可视化3.1将所有的组件都放在同一组图片上3.2将所有的ICA组件单独绘制本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195简介将CanICA应用于静息状态数据的示例。此示例将其应用于ADHD200数据集的30个主题。然后，它绘制一个...

2019-12-16 18:35:11 1697 6

原创 Nilearn教程系列(2)-3D和4D niimgs:处理和可视化

目录3D和4D niimgs:处理和可视化第一步：加载数据第二步：可视化可视化4D文件本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：9032901953D和4D niimgs:处理和可视化第一步：加载数据from nilearn import datasetsimport warningswarnings.filterw...

2019-12-15 20:36:49 1204

原创 Nilearn中的基本操作和查看

目录Nilearn简介Nilearn操作第一步：查看数据第二步：平滑操作第三步：保存结果到文件中本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195Nilearn简介Nilearn是一个Python模块，用于对神经成像数据进行快速、简单的统计学习。它利用scikit-learn python工具箱进行多变量统计，应...

2019-12-14 22:14:57 2502 1

原创 Python-EEG工具库MNE中文教程(9)-参考电极应用

目录MNE-Python中的参考引用简介无需重新引用(No re-referencing)平均参考(Average reference)单电极(A single electrode)多个电极的平均值(The mean of multiple electrodes)Python案例本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：9032...

2019-12-13 21:09:21 1770

原创 EEMD算法原理与python实现

目录EMD算法的不足EEMD算法的基本原理EEMD和EMD性能对比python实现EEMD案例本教程为脑机学习者Rose原创(转载请联系作者授权)发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195EMD算法的不足EMD算法能将原始信号不断进行分解，获取符合一定条件下的IMF分量。这些 IMF 分量之间的频率往往不同，这就为其在谐波检测方向的使...

2019-12-12 18:46:19 11302 9

原创脑机接口20年论文集汇总

目录卷一基础部分（The Foundation）基本方法（Essential Methods）啮齿动物和灵长类动物的实验性脑机接口研究（Experimental Brain-Machine Interfaces in Rodents and Primates）卷2帕金森病和脊髓损伤患者的临床脑机接口研究（Clinical Brain-Machine Interface Studies in Par...

2019-12-11 19:21:26 3011

原创 Python-EEG工具库MNE中文教程(8)-参考电极简介

目录参考电极简介设置脑电图参考案例-参考电极设置或更改参考通道设定平均参考本教程为脑机学习者Rose原创(转载请联系作者授权)发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195参考电极简介安置在头皮上的电极为作用电极(active electrode)。放置在身体相对零电位点的电极即为参考电极(reference electrode)，也称为...

2019-12-10 18:37:58 2861

原创参考电极简介

目录参考电极参考电极安置在头皮上的电极为作用电极(active electrode)。放置在身体相对零电位点的电极即为参考电极(reference electrode)，也称为参考电极或标准电极。记录到的脑电信号即是作用电极与参考电极的差值(电位差)。如果身体上有一个零电位点，那么将参考电极放置于这个点，头皮上其它部位与该点的电极之间的电位差就等于后者的电位变化的绝对值。但这种零电位点理论...

2019-12-10 18:23:08 2448

原创倒频谱原理与python实现

目录倒频谱定义倒频谱python案例本教程为脑机学习者Rose原创(转载请联系作者授权)发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195倒频谱定义倒频谱可以分析复杂频谱图上的周期结构，分离和提取在密集调频信号中的周期成分，对于具有同族谐频、异族谐频和多成分边频等复杂信号的分析非常有效。倒频谱变换是频域信号的傅立叶积分变换的再变换。时域信号...

2019-12-09 18:51:21 2365

原创基于脑电和特征加权阶段训练的驾驶员疲劳状态估计

目录导读论文贡献导读该研究基于脑电信号（EEG）的疲劳驾驶检测。论文考虑一个非常实用且非常具有挑战性的场景：没有关于新用户的任何EEG数据（有标签的或无标签的），但是希望通过老用户的带标注的EEG数据来建立一个模型，对新用户实现即插即用的疲劳程度估计。论文贡献该论文将ET从分类扩展到回归，并将其应用于基于EEG的驾驶员睡意估计中。论文的主要贡献是：1）提出了一种特征加权(FW)方案，该方...

2019-12-07 23:44:45 1089

原创 python读取.edf文件

目录EDF文件简介MNE-python读取.edf文件案例第一步：导入工具包第二步：加载本地edf文件第三步：获取原始数据中事件第四步：根据事件ID获取对应事件第五步：绘制事件图本教程为脑机学习者Rose原创(转载请联系作者授权)发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195EDF文件简介EDF，全称是 European Data Fo...

2019-12-06 19:31:45 13288 4

原创信号处理之功率谱原理与python实现

目录功率谱简介功率谱、能量谱、幅值谱之间的关系功率谱python实现本教程为脑机学习者Rose原创(转载请联系作者授权)发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195功率谱简介功率谱图又叫功率谱密度图功率谱是功率谱密度函数的简称，它定义为单位频带内的信号功率。它表示了信号功率随着频率的变化情况，即信号功率在频域的分布状况。功率谱表示了...

2019-12-05 19:45:44 15554 2

原创 EMD算法原理与python实现

目录简介EMD算法原理python实现EMD案例本教程为脑机学习者Rose原创(转载请联系作者授权)发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195简介SSVEP信号中含有自发脑电和大量外界干扰信号，属于典型的非线性非平稳信号。传统的滤波方法通常不满足对非线性非平稳分析的条件，1998年黄鄂提出希尔伯特黄变换(HHT)方法，其中包含经验模式...

2019-12-04 20:28:10 11622 8

原创 python读取.locs文件

目录简介知识点：案例本教程为脑机学习者Rose原创(转载请联系作者授权)发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195简介本案例主要介绍如何读取eeglab示例文件.locs文件。为了演示电极位置，所以需要读取.set文件。.set文件的读取详情请看python读取.set文件，这里就直接使用了。.set文件记录的是采集的信息，主要内容...

2019-12-03 18:41:08 1452 1

原创 python读取.set文件

目录简介知识点案例本教程为脑机学习者Rose原创(转载请联系作者授权)发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195简介本案例主要介绍如何读取eeglab示例文件.set.set文件记录的是采集的信息，主要内容包括通道数，事件数，开始时间与结束时间等。知识点mne中使用mne.io.read_raw_eeglab()读取.set文件...

2019-12-03 18:17:13 4841 2

原创稳态视觉诱发电位SSVEP简介

目录稳态视觉诱发电位(SSVEP)SSVEP信号原理与基础获取SSVEP信号要注意的点稳态视觉诱发电位(SSVEP)诱发电位主要有视觉诱发电位、听觉诱发电位以及触觉诱发电位三种。视觉诱发电位由于简单、方便被广泛应用于脑电信号的研究中。当视觉收到光或者图形闪烁等刺激时，脑电信号的电位会发生变化，这些电位的变化就是视觉诱发电位(Visual Evoked Potential, VEP)。视觉诱...

2019-12-02 18:15:25 5041

原创 Python-EEG工具库MNE-Python详细安装与使用

目录安装Python(推荐安装Anaconda)安装MNE-python下载MNE-Python中案例数据测试是否安装成功以及简单使用本教程为脑机学习者Rose发表于公众号：脑机接口社区(微信号：Brain_Computer).QQ交流群：903290195安装Python(推荐安装Anaconda)[这里是windows系统下的安装]Anaconda用来管理不同版本的Python环境，...

2019-12-01 20:18:05 11712 15

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