MPI程序的运行命令

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在运行MPI程序之前，首先用命令mpdtrace查看一下当前集群的运行状况，如果集群没有启动，需要用如下命令启动集群：

mpdboot -n 4 -f ~/mpd.hosts

我的集群是由node1、node2、node3、node4四台机器组成的。

由于MPI程序通常需要将各个进程指定给相应的机器节点来执行，所以MPI程序的运行命令会有比较长的参数，可以将这些参数写入一个配置文件，然后再执行这个配置文件。下面举例说明。

对于如下MPI程序，编译后生成可执行文件test：

#include <stdio.h>
#include <mpi.h>

int main(int argc, char **argv)
{
	int myid, numprocs;
	char host[10];

	MPI_Init(&argc, &argv);
	MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myid);
	MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
	
	gethostname(host, 10);
	printf("I am %d of %d at %s\n", myid, numprocs, host);

	MPI_Finalize();
	return 0;
}

如下是针对上述程序的配置文件pgfile:

-n 1 -host node1 ./test
-n 1 -host node2 ./test
-n 1 -host node1 ./test
-n 1 -host node4 ./test
-n 1 -host node3 ./test
-n 1 -host node3 ./test

执行如下命令：

mpiexec -configfile pgfile

运行结果如下：

I am 0 of 6 at node1
I am 3 of 6 at node4
I am 2 of 6 at node1
I am 5 of 6 at node3
I am 1 of 6 at node2
I am 4 of 6 at node3

需要注意的是：

配置文件中的每一行都指定产生一个进程，并且第一行产生0号进程，第二行产生1号进程，后面依次类推，如果想将某个进程绑定在某个节点上执行，就需要将主机名写在进程号所属的那一行。