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转载 mpich2多机协同作业
转自 http://blog.sina.com.cn/s/blog_4be5711f0101a41z.html一、单机测试。1、命令行方式:注册:mpiexec -register输入你当前登陆帐户名和密码,不注册的话每次执行程序都要求输入帐户和密码。运行:mpiexec -n 2 helloworld.exe这里用两个进程执行当前目录下的hel
2012-10-30 16:39:28 7752
转载 NCBI RefSeq命名格式的详细说明
转自:http://liucheng.name/379/ NCBIRefSeq (美国国立生物技术信息中心参考序列库) 是目前世界上最具有权威性的序列数据库。NCBI的参考序列计划(RefSeq)将为中心法则中自然存在的分子,从染色体到mRNA到蛋白提供参考序列标准。RefSeq标准为人类基因组的功能注解提供一个基础。它们为突变分析,基因表达研究,和多态发现提供一个稳定的参考点。
2012-10-30 11:51:30 6443
转载 Graphviz介绍
转自 http://abruzzi.iteye.com/blog/429042graphviz是贝尔实验室几个计算机牛人设计的一个开源的图表(计算机科学中数据结构中的图)可视化项目,主要用C语言实现,主要实现了一些图布局算法。通过这些算法,可以将图中的节点在画布上比较均匀的分布,缩短节点之间的边长,并且尽量的减少边的交叉。 graphviz提供命令式的绘图方式,它提供一个dot语言
2012-10-13 14:59:39 1935
原创 差异表达分析软件GFOLD安装以及GSL安装问题
同济GFOLD软件是一款根据mapping结果直接进行差异表达分析的软件,http://www.tongji.edu.cn/~zhanglab/GFOLD/index.html,文献中提到,该软件在分析无重复的转录组数据的时候,不以p值为计算依据,而是以GFOLD值作为标准筛选差异表达基因,命令也比较简单。国产软件还是支持一下。结果要优于其他DESeq、edgeR、cuffldiff等软件,故
2012-10-10 17:59:46 7792 1
转载 UE正则表达式使用
分别来自http://baizheng.iteye.com/blog/37637和space.itpub.net/12350275/viewspace-682549下面是对UltraEdit的Help中针对查找替换使用正则表达式部分的整理,最后还有我前两天用到的一个多行代码查找替换的例子。Ultraedit在使用正则表达式进行查找替换时有两个可使用的语法集合。一个是 UltraEd
2012-10-10 11:01:07 51000 2
空空如也
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