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原创 关于illumina产生的测序源文件bcl转换成fastq格式的问题

由于连接测序仪的服务器不知道哪里抽了风,无法直接的生成fastq格式的文件,好久都无解,经过一段时间仍无法解决,所以采用曲线救国的方法,看能不能利用三方软件将bcl转换成fastq文件     google以后发现illumina的OLB(off-line Basecaller)软件可以实现从bcl格式转换成qseq格式,而qseq格式就可以通过简单的perl或者shell或者java脚本转换成

2013-03-12 10:41:12 11756 2

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