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原创 Ubuntu/CentOS 高亮显示终端信息栏，给终端用户名改颜色(醒目)
命令,再.bashrc文件最后直接添加root用户：PS1='${debian_chroot:+($debian_chroot)}\[\033[01;31m\]\u\[\033[00m\]@\h: \[\033[01;36m\]\w\[\033[00m\] \[\t\]\n\$ 'export LS_COLORS=$LS_COLORS"*.py=00;35:*.pl=00;32...
2016-08-14 16:55:47
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原创 在Linux(CentOS/Ununtu)中安装Circos
源码安装在 Linux中安装，首先要去网站下载源码包，按照说明进行如下操作：wget http://circos.ca/distribution/circos-0.69-6.tgztar xvfz circos-0.69-6.tgzcd circos-0.69-6.tgz然后还要安装下面这些Perl模块，以Config::General为例，安装方法是：sudo perl ...
2016-08-23 12:56:15
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原创 linux(ubuntu) 切换用户
普通用户如 biolxy@lxy:$切换到root 用户 (需要root密码)su 或则 su-成功root@lxy:# 再切回普通用户su - biolxyokbiolxy@lxy:$
2016-08-18 21:04:00
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原创 Linux下如何查看每个用户的磁盘使用数量？
du -sh *查看当期问价夹下所有文件夹（及其子文件，文件夹）的大小如要查看所用用户的占用的大小，需要root权限du -sh看总的
2016-08-16 17:00:47
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原创 shell中产生随机数的方法
echo $RANDOMRANDOM是shell内置的随机数for i in `seq 10000`;do echo $RANDOM >> 1.txt;done产生10000个随机数cat 1.txt |awk '{if(length($0)统计随机数中小于等于3位数的个数echo $((RANDOM %10))产生0-9的随机数echo $RANDOM |m
2016-08-16 10:01:36
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原创 liunx 录制命令 script
script -a action.log -t time.log然后你输入的命令都会被记录下来知道你输入exit ，终止播放时使用 script time.log action.log你输入的命令就会被播放出来
2016-08-16 09:45:13
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原创 shell 中产生一个的计算
shell 中的计算echo $((20*20))400% 符 是取余数 + - * / 其他都一其他计算 有 a= 1, b= 2 expr $a + $b3let $a +$b3或则 echo [1+3]4在或者echo 1 + 2 |bc3
2016-08-16 09:41:19
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原创 R 从表达数据中调出我们要的基因的表达值
A是我们测序的数据文件，里面有几万个基因的表达之，怎么调出我们想要的文件呢载入B文件，B文件的第一列是我们的基因ID在R里面键入exp_B 解释： 这里A文件的行名是基因的ID，我们调出B文件的第一列，用as.character将其变为字符，作为调取表达值时的的行名输出结果，键入write.table(exp_B,"I:/exp_B.txt",sep = "\t")将该
2016-08-13 18:09:15
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转载 如何从CPAN安装Perl模块
sudo perl -MCPAN -e shellcpan> install HTML::Template转载自点击打开链接
2016-08-08 13:50:08
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原创 How do I convert GFF file to a GTF file? 怎么把gff文件变成gtf文件
首先需要 安装cufflink 软件，里面有一个程序gffreadgffread my.gff3 -T -o my.gtf
2016-08-08 13:48:09
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原创 如何让linux终端显示/不显示 路径
首先进入root下,编辑.bashrc文件cd rootvim .bashrc该文件为root用户环境配置文件找到export PS1 对应的这一行export PS1='${debian_chroot:+($debian_chroot)}\u@\h:\w\$ '\u表示:用户名\h表示：主机名\$表示:终端提示符，$为一般用户,#为root用户把其中\w删除即可
2016-08-07 13:27:43
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原创 统计.fa文件中序列长度
perl /home/lixiangyong/software/length.pl Gma.glub.fa > length.txt
2016-08-06 16:22:16
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转载 .sam 文件介绍
QNAME，比对片段的（template）的编号；FLAG，位标识，template mapping情况的数字表示，每一个数字代表一种比对情况，这里的值是符合情况的数字相加总和；RNAME，参考序列的编号，如果注释中对SQ-SN进行了定义，这里必须和其保持一致，另外对于没有mapping上的序列，这里是’*‘；POS，比对上的位置，注意是从1开始计数，没有比对上，此处为0；MAPQ
2016-08-05 21:17:27
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转载 Linux下查看软件安装路径
1、 查询软件安装路径 在Linux操作系统中查看软件安装路径是通过whereis 命令，如查看php软件的安装路径时输入命令：whereis php2、查询运行文件所在地址（文件夹地址） 查询软件文件夹地址的方法是通过which命令。如查看php文件夹的地址：where php原文链接点击打开链接
2016-08-01 15:00:14
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生物信息学算法导论（an-introduction-to-bioinformatics-algorithms）
2018-08-09
空空如也
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