2013年08月_OpenHero

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翻译 blast数据库含义

Databasesblast的数据库里面有这几个数据库，每一个的具体含义：https://ncisf.org/index.php?q=software-databases/blast-databasesA list of the databases available on the cluster, including information about the database, it's so

2013-08-27 14:39:28 6043

原创 NCBI SRA数据预处理

SRA数据的的处理流程大概如下一、SRA数据下载、NCBI 上存储的数据现在大都存储为SRA格式。下载以后就是以SRA为后缀名。这里可以通过三种方式下载SRA格式的数据。1.通过http方式，2.通过ftp方式，3.通过AsperaAspera可以在NCBI网站上下载。参阅：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK47540/二、SRA格式转换成FASTQ格式./

2013-08-25 22:32:01 22169 4

原创【G-BLASTN 1.0正式发布】

【G-BLASTN 1.0正式发布】G-BLASTN使用GPU来加速NCBI-BLAST里的BLASTN模块，单块GTX780比四核CPU平均快6倍。

2013-08-23 02:04:33 5110 7

原创 CUDA 5.5 Production Release

CUDA 5.5 Production Release is now available to everyone athttps://developer.nvidia.com/cuda-downloads值得一提的是针对ARM的release出来了。ARM高性能计算，各个公司都在为接下来几年的发展开始圈地了。。

2013-08-01 09:59:43 5150 6