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RSS订阅转载 Tensor flow 简介
转载自：http://www.infoq.com/cn/articles/deeplearning-tensorflow-actual-combat深度学习及TensorFlow简介深度学习目前已经被应用到图像识别，语音识别，自然语言处理，机器翻译等场景并取得了很好的行业应用效果。至今已有数种深度学习框架，如TensorFlow、Caffe、Theano、Tor
2017-02-26 01:34:19
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原创 bam deal
pibase tools for validational and comparative analysis of BAM filespibase is an open-source package of linux command line tools for validating next-generation sequencing loci (SNPs and loci of interes
2017-02-24 14:08:13
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转载 fastq ：怎么判断fastq是Phred33格式还是Phred64 格式
现在的一般都是Phred33的吧。。如果质量值对应的ASIIC码的值，有比64小的，那么他就是Phred33.如果有比73大的，那么就是Phred64体系的。这么说对吧？不对的请指正。以下属于转载：最近在学习质控知识时, 对于质量值体系及转换产生了一些疑问, 作了一些尝试, 趁集群故障, 在此总结一下质量值体系相比之前培训时所学的质控内容, (我拿到的) 流程中还多了一步 phred33t
2017-02-22 17:29:42
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转载 程序员不好好写报告的结果是很严重的
转自：http://blog.sciencenet.cn/blog-404304-884328.html倒腾了很久的代码，结果测试也通过了，然后现在要写报告了，心情的表情马上从呲牙变成咧嘴。倒腾了一上午，一直在摸索怎样在linux平台上把报告怎么快速搞出来，然而这个对我来说好像太不效率了，好了，不搞逗了，老老实实作报告吧。谨以下文，安慰我这种兔子乱跳的心情。按惯例先讲点废话
2017-02-22 15:18:06
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转载 fastq文件格式处理工具系列学习
转自：http://ju.outofmemory.cn/entry/215236fastq文件格式说明（wiki）FASTQ_format 维基百科NSC_2011_Illumina_fastqAndQC Illumina fastq 格式官方文档fastq 文件质量控制fastqc CommandLine Demo：./FastQC/fastqc -o
2017-02-22 14:54:16
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转载 GATK使用方法详解（原始数据的处理）
转自：https://www.plob.org/article/7009.html1. 对原始下机fastq文件进行过滤和比对（mapping）对于Illumina下机数据推荐使用bwa进行mapping。Bwa比对步骤大致如下：（1）对参考基因组构建索引：例子：bwa index -a bwtsw hg19.fa。最后生成文件：hg19.fa.amb、hg19.fa.an
2017-02-22 14:50:10
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空空如也
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