R基础入门教程

由于一个项目原因,需要用到R对数据进行回归分析和数据挖掘,因此花半天时间对R进行了一个基础的学习。这是之前整理的网易云课程上的一个视频教程中整理的。

这里贴出来,也提供给源代码下载地址(http://pan.baidu.com/s/1c1mV0Xy),方便大家直接在RStudio中执行测试,也方便自己和大家在学习过程中对基本的指令的查询。

我刚发现,有可能第一次打开会出现乱码。这时候在RStudio中选择tools->global options->code->saving里面将text encoding设置为UTF-8就好啦~

安装RStudio之前必须先安装R,安装包下载地址给分享给大家。

R安装包:http://pan.baidu.com/s/1bnYK2g3

RStudio安装包:http://pan.baidu.com/s/1nu0kvVj

照着敲一遍,包你入门啦~不要偷懒!!不想往下看的话,就去下载上面给出链接的源代码tutorial.R文件哦。


#########################R learning##############
###1.R introduction ####
#语言历史和特点

#1.1 R语言历史####
#R是S语言的一种实现。S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、
#统计分析、作图的解释型语言。最初S语言的实现版本主要是S-PLUS.
#S-PLUS是一个商业软件,它基于S语言,并由MathSoft公司的统计科学部进一步完善。
#后来Auckland大学的Robert Gentleman和Ross Ihaka及其他志愿人员开发了一个R系统
#R的使用与S-PLUS有很多类似之处,两个软件有一定的兼容性

#1.2 R的特点####
#1.有效地数据处理和保存机制
#2.拥有一整套数组和矩阵的操作运算符
#3.一系列连贯而又完整的数据分析中间工具
#4.图形统计可以对数据直接进行分析和显示,可用于多种图形设备。
#5.一种相当完善、简洁和高效的程序设计语言。包括条件语句、循环语句、用户自定义的递归函数以及输入输出接口。
#6.R语言是彻底面向对象的统计编程语言
#7.R语言和其他编程语言、数据库之间有很好的接口
#8.R语言是自由软件,可以放心大胆地使用,但其功能却不必任何其他同类软件差
#9.R语言具有丰富的网上资源

###2. Rstudio和R的基本操作####

#2.1查看R语言自带的数据集
data()

#直接输入数据集的名称,查看数据
CO2

#2.2快捷键
#Ctrl+Enter:
#Ctrl+L:
#Ctrl+Shift+S:
#Ctrl+1:
#Ctrl+2:
#Ctrl+D:

#2.3查看数据集的前6行####
head(CO2)
#查看数据集的最后6行
tail(CO2)

#2.4安装包(可以通过命令或者图形界面来咱安装)####
installed.packages("ggplot2")

#加载包
library(ggplot2)

#2.5创建向量和矩阵以及对它们的基本操作####
x1 <- c(1,2,3,4,5,6)
x2 <- c(2,4,6,8,10,12)

length(x1)

mode(x1)

class(x1)

rbind(x1,x2)     #行联合

cbind(x1, x2)    #列联合

Dmat<-cbind(x1,x2)
class(Dmat)   #使用c函数结合的变量组成的是矩阵

Dmat<-rbind(x1,x2)
class(Dmat)

Dframe<-as.data.frame(cbind(x1,x2))
class(Dframe)

Dmat;Dframe  #矩阵和数据框格式是不一样的,矩阵是由行列组成的,数据框是由记录和变量组成的

a<-c(1:100)
length(a)
cbind(a)
a

#2.6常用的函数####
b<-c(1:20)

mean(b)   #均值

sum(b)    #求和

max(b)    #求最大值

min(b)   #求最小值

sd(b)    #标准差

#2.7产生向量####
1:5

1:5*2

1:5*2+1

#2.8查看内存中已有的对象####
ls()

#删除当前内存中的所有对象
rm(list=ls())
ls()

#2.9访问向量中的元素####
a<-1:5*2-1
a
a[3]
a[-3]
a[2:4]
a[-(2:4)]
a[1,2,3]   #不能这样访问向量中的元素
a[c(1,2,3)]
a[a<=5]
a[a<=3 | a >= 7]
a[a>=3 & a <= 7]
a[a[2]]

#2.10 seq()函数和rep()函数,用来产生等差数列的函数,调用实例函数####
example("seq")
seq(0, 1, length.out = 11)

seq(stats::rnorm(20)) # effectively 'along'

seq(1, 9, by = 2)     # matches 'end'

seq(1, 9, by = pi)    # stays below 'end'

seq(1, 6, by = 3)

seq(1.575, 5.125, by = 0.05)

seq(17) # same as 1:17, or even better seq_len(17)

example(rep)
rep(1:4, 2)

rep(1:4, each = 2)       # not the same.

rep(1:4, c(2,2,2,2))     # same as second.

rep(1:4, c(2,1,2,1))

rep(1:4, each = 2, len = 4)    # first 4 only.

rep(1:4, each = 2, len = 10)   # 8 integers plus two recycled 1's.

rep(1:4, each = 2, times = 3)  # length 24, 3 complete replications

rep(1, 40*(1-.8)) # length 7 on most platforms

rep(1, 40*(1-.8)+1e-7) # better

## replicate a list
fred <- list(happy = 1:10, name = "squash")
rep(fred, 5)

# date-time objects
x <- .leap.seconds[1:3]
rep(x, 2)

rep(as.POSIXlt(x), rep(2, 3))

## named factor
x <- factor(LETTERS[1:4]); names(x) <- letters[1:4]

rep(x, 2)

rep(x, each = 2)

rep.int(x, 2)  # no names

rep> rep_len(x, 10)


#2.11 产生字母序列####
letters[1:30]

#2.12 which()函数####
a<-rnorm(10)
a
which.max(a)  #返回数组中最大的数的位置
which.min(a)   #返回数组中最小的数的位置
a[which.max(a)]
which(a==a[which.max(a)])
which(a>0)
a[which(a>0)]

#2.13排序函数####
a<-1:10
a
rev(a)   #反转顺序

a<-c(3,1,5,6,9,2,7,4,6,5)
sort(a)
rev(sort(a))

#2.14生成矩阵####
a<-c(1:36)
a
a1<-matrix(a,nrow = 9, ncol = 4);a1
a2<-matrix(a,nrow = 4, ncol = 9);a2
a3<-matrix(a,nrow = 9, ncol = 4, byrow = TRUE);a3
dim(a1)   #查看函数的维度
dim(a2)[1]   #行
dim(a3)[2]   #列

#矩阵运算
t(a1)    #转置
a1+a2
a1+a3

#2.15改变RStudio的工作界面(通过tools里面的layout设置完成)####

#2.16 设定工作目录,方便载入数据,将数据存放在设定的目录中,载入数据时就不用指定路径了####
setwd("F:/feiguR/data")
setwd("F:\\feiguR\\data")


getwd()  #用于查看当前工作目录

#2.17 help()函数####
help("seq")
?seq
help(package="ggplot2")

#2.18 example()函数####
example("seq")
example("hist")
example("plot")

#搜索自己需要的函数
help.search("multivariate normal")

#2.19 数据框 dataframe####
##数据框就是一个数据表格,一行表示一个记录,一列表示一个变量
x1<-c(1,2,3,4,5,6,7,8,9)
x2<-c(2,4,6,8,10,12,14,16,18)
x<-data.frame(x1,x2);x
x=data.frame('weight'=x1, 'cost'=x2);x
x$"feerate"<-x$cost/x$weight    #数据框可以利用已有的变量产生新的变量并存储于当前数据框中
names(x)   #查看数据框中的变量
str(x)    #查看数据框中数据的定义
#我们在载入数据后,要使用上面的两个函数来检查数据载入是否成功,并检查数据的定义

#2.20 列表list() ####
x1<-1  #单个数字,其实是一个只有一个元素的一维向量

x2<-c(1,2,3,4)

x3<-c("a","bc","d")    #字符向量

x4<-matrix(1:36,nrow = 9,ncol = 4)    #矩阵,vector

x5<-data.frame(a=c(1,2,3,4), b=c(2,3,4,5),c=c(3,4,5,6))

list_01<-list(x1=x1,x2=x2,x3=x3,x4=x4,x5=x5)     #产生一个数据框

list_01$x3


###3. 数据导入与导出 ####

#3.1 先把R内置的CO2数据集导出,然后再联系导入操作####
write.table(CO2,file="二氧化碳.txt")
write.csv(CO2,file = "二氧化碳.csv")

#3.2 导入逗号分割的文本文件####
read.table(file = "二氧化碳.txt", header = TRUE)
#最好指定一个名称
carbon<-read.table(file = "二氧化碳.txt", header = TRUE)

#3.3 导入csv格式的数据####
carbon_csv<-read.csv(file = "二氧化碳.csv", header = TRUE)

#3.4通过剪贴板读入数据并写入文件
setwd("F:/feiguR")
clipboard<-read.table("clipboard",header = TRUE)
clipboard

write.table(clipboard, file = "clipboard.txt")

#3.5 导入空格分割的文本文件数据####
setwd("F:/feiguR")
lowtem<-read.table(file = "lowtemperature.prn", header = TRUE)
names(lowtem);str(lowtem)

lowtem$fyear<-factor(lowtem$year, c(2013,2014,2015), labels = c("2013年","2014年","2015年"))
#此处设计重新编码变量的操作

#3.5.1 读取数据框中的变量####
#1)很多函数中有data参数,可以指定数据框,然后在函数内部直接访问数据框中的变量
boxplot(lowtem~year, data = lowtem)

#2)使用美元符号$
boxplot(lowtem$lowtem~lowtem$year)

#3)使用attach函数,不推荐使用,很容易出错,特别是在同一个R代码及中写很多不同程序的时候
attach(lowtem)
boxplot(lowtem~year)
detach(lowtem)

###3.6 数据子集操作####
#1)先明确分类变量有几个类别
unique(lowtem$year)
#2)选择数据子集
lowtem_15<-lowtem[lowtem$year=2015,]
plot.ts(lowtem_15$lowtem)
#3)多个条件用逻辑连接符号进行连接
lowtem_1501<-lowtem[lowtem$year==2015 & lowtem$day=="1/1",]
lowtem_1501
#4)排序操作
#按照日最低气温进行排序,这个排序可能没有实际意义,这里只是演示操作的方便
orderlowtem<-lowtem[order(lowtem$lowtem),]    #对行的操作
View(orderlowtem)

#5)合并数据子集
#加入三年的气温数据是分开的,我们要将它们合并到一个数据集中
#(1)先读入数据
setwd("F:/feiguR")
hightem<-read.table("clipboard",header = TRUE)  #通过剪切板读入数据
write.table(hightem, file = "hightem.txt", quote = FALSE)  #将这个数据保存一边下次使用

lowtem<-read.table(file = "lowtemperature.prn", header = TRUE)
#(2)然后进行合并
colnames(hightem)<-c("day","year","hightem")  #由于变量名称大小写不一致,对最高温度的数据集变量名称进行重命名

tem<-merge(hightem, lowtem, by=c("year", "day"))

tem$day<-as.Date(tem$day)

#(3)合并后有一个问题就是时间序列被打乱了
#暂时解决办法是把文件写入csv文件,用excel重新编辑日期,并排序后重新导入

tem_new<-read.csv(file = "tem.csv", header = TRUE)
head(tem_new)

#3.7 读入excel格式的文件####
install.packages("RODBC")  #注意有些包只在特定版本中能够运行,更新问题
library(RODBC)

xls<-odbcConnectExcel("wechat.xls")  #odbcConnectExcel is only usable with 32-bit Windows


###4. 常用的函数####

##4.1 tapply函数(用来对某数值变量依据另外一个分类变量求某值)####
setwd("F:/feiguR")

tem_new<-read.csv(file = "tem.csv", header = TRUE)  
head(tem_new)
str(tem_new)

tapply(tem_new$lowtem, tem_new$year, mean)  #计算最低气温均值
tapply(tem_new$hightem, tem_new$year, mean)  #计算最高气温均值
tapply(tem_new_lowtem, tem_new$year, sd)   #计算最低气温方差

###4.2 sapply()函数 和 lapply()函数(对多个变量求某函数的结果)####
sapply(tem_new[,4:5], mean) #输出为向量
lapply(tem_new[,4:5], mean)  #输出为列表

##4.3 summary()函数  用来输出汇总信息####
a<-summary(tem_new)

b<-summary(tem_new$year)

c<-summary(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9))

d<-lm(tem_new$hightem~tem_new$lowtem)

e<-summary(d)

class(a);class(b);class(c);class(d);class(e)   #summary函数的输出非常丰富,是一种列表

e$coeeficients

###4.4. table函数  (用于单变量的频数统计,多分类变量的交叉分析)####

example("table")  

#4.4.1 简单的频数统计####
rpois(100,5)
table(rpois(100,5))

#4.4.2 查看表的结构(可用于对数据框中两个分类变量进行交叉分析)####
View(warpbreaks)
with(warpbreaks, table(wool, tension))

###5. 绘图工具 ####

#5.1 基本绘图函数plot() ####
View(cars) 
help(cars)    #速度与刹车距离

head(cars)

plot(cars)

plot(cars$dist~cars$speed)   #指定y轴表示刹车距离

plot(cars$speed~cars$dist)   #指定x轴表示刹车距离

#5.2 为了方便将两幅图在一起进行对比####
windows()  #用单独的窗口显示图形以获得更好的显示效果,注意windows命令在前

par(mfrow=c(2,2))

plot(cars$dist~cars$speed) 

plot(cars$speed~cars$dist)

#5.3函数的参数####
plot(cars$dist~cars$speed,  #y~x
     main="刹车距离与车速之间的关系",  #画标题
     xlab="Speed(miles per hour)",       #X坐标轴标题
     ylab = "Distance travelled(miles)",     #y坐标轴标题
     xlim = c(0,30),  #x坐标轴范围
     ylim = c(0,140),     #y坐标轴范围
     xaxs = "i",    #设置x轴风格为internal
     yaxs = "i",     #设置y轴风格为internal
     col = "red",    #设置散点的颜色为红色
     pch = 19         #设置散点的形状为实心圆点
)

#5.4 绘制线图 ####

#使用微信公众号数据
setwd("...")

num<-read.csv(file = "wechat.csv")
head(num)

windows()
plot(num$NetGrowth~as.Date(num$date),
     type="1",
     main="每日净增长变化",
     xlab="date",
     ylab="每日净增长人数",
     col = "red"
)

##5.5 低水平绘图函数lines() ####
lines(num$NetGrowth~as.Date(num$date),col = "red")

example("lines")

plot(cars, main = "Stopping Distance versus Speed")

lines(stats::lowess(cars))  #此代码为散点图加上光滑的曲线

#5.6 柱形图####
#使用数据集BOD
View(BOD)

#使用基础绘图包
barplot(BOD$demand, names.arg = BOD$Time)
#先输出频数表,然后在用条形图绘制
table(mtcars$cyl)
barplot(table(mtcars$cyl))

#改变图形的方向
windows()
par(mfrow=c(1,2))
barplot(BOD$demand, names.arg = BOD$Time)
barplot(BOD$demand, names.arg = BOD$Time, horiz = TRUE)


#5.7 绘制直方图####
windows()
par(mfrow=c(1,2))
hist(mtcars$mpg)

hist(mtcars$mpg, breaks = 10)   #控制分区数目

#5.8 绘制箱线图####
#使用数据集ToothGrowth
View(ToothGrowth)
#使用plot函数时,当x轴为分类变量,y轴为数值型变量时,默认输出箱线图
plot(ToothGrowth$supp, ToothGrowth$len)


#5.9 绘图设备(输出图形的格式)####
?device

setwd("F:/feiguR")
pdf("fly.pdf")   #在图形设备中输出图形名称
plot(ToothGrowth$supp, ToothGrowth$len) 
dev.off()    #关闭当前图形设备,相当于保存该图形


png("fly.png")
plot(ToothGrowth$supp, ToothGrowth$len) 
dev.off() 


pdf("xxx.pdf")   #在你希望将所有图形输出到一个文件中时,这样做不支持PNG格式
hist(mtcars$mpg)
hist(mtcars$mpg, breaks = 10)
plot(ToothGrowth$supp, ToothGrowth$len) 

dev.off()

#图形设备设置

dev.cur()           #查看当前正在使用的图形设备
dev.set(3)       #把当前正在使用的图形设备设置为其他设备

#5.10 其他常用图形####
example("pie")        #查看饼图的使用方法和实例

example("plot.ts")

#5.11 绘图参数####

setwd("F:/feiguR")
wec<-read.csv(file = "wechat.csv", header = TRUE)

head(wec)
windows()
plot.ts(wec$NetGrowth, col="red")
points(wec$NetGrowth, bg="skyblue", color="red", pch=21)
abline(h=mean(wec$NetGrowth), col="blue")
title("公众号日增净关注人数变化")
box()

#5.12 生成时间序列的函数####

ts(1:10, frequency = 4, start = c(1959,2))   #生成时间序列,季度,起始

print(ts(1:10, frequency = 7, start = c(12,2)), calendar = TRUE)    #星期 日历

gnp<- ts(cumsum(1+round(rnorm(100),2)), start = c(1954,7), frequency = 12) 
z <- ts(matrix(rnorm(300), 100, 3), start = c(1961,1), frequency = 12)
class(z)
head(z)
plot(z)


###6. R语言与统计####

###7. 循环与自定义函数####
#7.1 for循环####
example("for")

for (i in 1:5) {     #循环遍历每个数,每取出一个数就打印一个向量
  print(1:i)
}

for (n in c(2,5,10,20,50)) {  
  x <- stats::rnorm(n)    #生成含有n个数的正态分布
  cat(n, ":", sum(x^2), "\n")  #对应每一个数,计算生成的正太分布数组的平方和
}

f<-factor(sample(letters[1:5], 10, replace = TRUE));f    #抽样,生成字母序列

for (i in unique(f)) {  #依次去除序列中的每一个独有的值
  print(i)
}

#7.2 while语句####
a[1]<-1; i<-1

while(a[i] < 100){
  i = i + 1;
  a[i] <- a[i-1]+3
}


#7.3 自定义函数####
myfunc_cv<-function(x){   #函数在R中也是一个对象
  cv<-sd(x)/mean(x)
  return(cv)       #变异系数
}


#测试该函数
a<-c(1,2,5,8,9,6)
myfunc_cv(a)

#7.4 通过循环和自定义函数来验证中心极限定理####
myfun<-function(a){
  x<-1:100   #先生成一个1到100的序列,后面可以更改这些值,相当于覆盖掉原来的值
  x<-data.frame(x)
  a<-data.frame(a)
  
  for (i in 1:100) {     #设置循环,循环抽取100个样本,并将计算出来的均值付给数据框中的x变量
    c<-a[sample(nrow(a), 1000),]
    m = mean(c)
    x$x[i] = m
  }
  
  windows(1280,720);par(mfrow=c(1,2))
  plot(density(a$a),main="这是原来的分布")
  plot(density(x$x), main = "这是抽取的样本的均数的分布")
}

a<-c(1:1000)
myfun(a)

###7.4.1 正态分布####
a<-rnorm(10000,0,1)
myfun(a)

###7.4.2 指数分布####
b<-rexp(10000,1)
myfun(b)

###7.4.3 t分布####
c<-rt(1000,3)
myfun(c)

###7.4.4 F分布####
d<-rchisq(100000,1)
myfun(d)


###8.数据处理####

###8.1 把数据框变长####


其中的条目最后的四个'#'号是做成目录的一个代码(必须只能是四个‘#’号),在RStudio中可以直接在代码编辑框下面选择。


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