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原创 药物研发早期预测细胞毒性的解决方案

在研究中经常会涉及DNA或染色体的损伤,因为DNA损伤与很多疾病的发生有密切的关系,如遗传疾病、肿瘤等。在体外培养,如果将培养的细胞加入圆底的微孔中,这些富集的细胞就会形成离散的球体。这些离散的球体同时包含了暴露在表面的和深埋在内部的细胞,增殖的和非增殖的细胞,外面的富氧层和内部的缺氧中心。这个完整的实验方案包括了预置模块对延时拍摄的图片进行分析,基于明场的图像识别所有细胞,基于荧光蛋白的表达区分不同的细胞周期。左图毒性化合物的IC50曲线,依据测量的神经突触和细胞核大小显示的毒性所绘制。

2023-05-19 09:33:11 364 1

原创 快速了解靶点预测的方法!

基于网络推理方法是指利用实验数据和计算方法推断药物-靶标二分网格的拓扑和因果关系结构,预测和实验确证疾病的蛋白质或基因网络,发现药物的新靶标或预测全新的药物-靶标相互作用关系。相似性搜索方法依据化学结构或物理化学性质相似的小分子化合物可作用于性质相同或相近的靶标这一理论假设,通过比较目标分子与具有已知靶标的活性分子的化学结构或物理化学性质,去预测目标分子的潜在作用靶标。基于配体的靶标预测,是指将需要预测靶标的化合物与具有已知靶标的化合物的结构特征进行比较分析,从而根据相似性原理预测潜在靶标。

2023-05-18 09:45:46 574

原创 新药研发开始“狂飙”,生物制药行业机遇再现。

机器学习技术能利用复杂的算法在大规模、异质性数据集中进行运行,在生物医学方面、人类基因组项目、癌症全基因组项目、等项目上都表现出了巨大的潜力,收集并分析与医学疗法和患者预后相关的大量数据集或能将医学转化称为一种数据驱动、以结果为导向的学科,其对于疾病的检测、诊断都有着非常深远的影响。研究领域涉及机器学习,芯片数据分析,核酸及蛋白序列分析,DNA,RNA,甲基化测序数据分析,单细胞测序数据分析,miRNA及靶基因分析,癌症相关基因预测及预后分析等,发表SCI论文30余篇,其中一作及并列一作15篇。

2023-05-12 10:29:46 488 1

原创 Nature| 论2023年最新“ 颠覆性 ”技术,人工智能在基因组学与单细胞直线开挂

生物医学是综合医学、生命科学和生物学的理论和方法而发展起来的前沿交叉学科,基本任务是运用生物学及工程技术手段研究和解决生命科学,特别是医学中的有关问题。机器学习技术能利用复杂的算法在大规模、异质性数据集中进行运行,在生物医学方面、人类基因组项目、癌症全基因组项目、等项目上都表现出了巨大的潜力,收集并分析与医学疗法和患者预后相关的大量数据集或能将医学转化称为一种数据驱动、以结果为导向的学科,其对于疾病的检测、诊断都有着非常深远的影响。

2023-05-08 17:23:28 629

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