Common 8 protein databases in Bioinformatic analysis(生信分析种8种常用的蛋白质数据库)

本文介绍了8个在生物信息学分析中常用的蛋白质数据库,包括UniProt、Human Protein Atlas、InterPro、PDB、Binding DB、String、GeneCards和Genatlas,涵盖了蛋白质结构、功能、相互作用和表达信息等方面,对于生命科学研究和药物开发具有重要价值。

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蛋白质是调控生命功能的基本层次,在生命科学研究上具有重要意义,因此受到科研工作重点关注!也是很多小伙伴发文的热点方向!

但由于执行复杂生命功能的蛋白质的结构和功能等的多样性都很高,收录蛋白质信息的数据库往往各有所侧重。这里将整理8种数据库,在生信写作中都能起到作用

下列是8种常用的蛋白数据库

1.UniProt

网址:https://www.uniprot.org

数据:

各物种基因组测序完成后得到的全基因蛋白质序列,并包含了很多来自文献中的蛋白及其功能信息。

由Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD三大子数据库构成

尤其是Swiss-prot 子数据库,库中蛋白质信息都是手工核对过的 ,非冗余,详细注释信息的蛋白数据。 

2.Human Protein Atlas

网址:https://www.proteinatlas.org
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