R语言多元数据统计分析在生态环境中的实践应用

本文详细介绍了R语言在生态环境领域进行多元统计分析的应用,涵盖聚类分析、辨别分析、非约束排序和约束排序等方法,包括PCA、CA、DCA、NMDS、RDA、dbRDA、CCA等。内容涉及数据准备、方法选择、实例解析和结果作图,旨在帮助初学者理解和掌握多元统计分析在生态环境研究中的实践技巧。
摘要由CSDN通过智能技术生成

生态环境领域研究中常常面对众多的不同类型的数据或变量,当要同时分析多个因变量(y)时需要用到多元统计分析(multivariate statistical analysis)。多元统计分析内容丰富,应用广泛,是非常重要和实用的多元数据分析方法和统计工具,其中分类(classification)/分组(grouping)和梯度(gradient)/排序(ordination)分析是多元统计分析的核心内容。分类/分组分析主要包括聚类(如层次聚类和k-means聚类等)和辨别分析(如线性辨别分析和mental检验等);梯度/排序分析分为非约束排序(如PCA和CA等)和约束排序(如RDA和CCA等)两大类(详见介绍)。

但初学者在应用多元统计分析方法时往往非常困惑,这种困惑主要来自几个方面:

  1. 首先,多元统计方法众多,分类还是排序?约束排序还是非约束排序?
  2. 哪种方法或技术更适合我的研究目的或数据?
  3. 其次,在多元分析中很多术语都有别称,如非约束排序也叫间接梯度分析;
  4. 再次,多元数据类型包括连续型数据、计数数据、分类数据及混合类型数据,不同数据类型如何选择合适的方法?等等等等。

本内容将梳理多元统计中分类/分组和排序/梯度分析各方法不同应用情境,包括生态环境多元数据分析概述、R基础及数据探索、多元数据梯度分析、多元数据分组分析及统计结果作图、通过大量具体案例,利用R语言相关包示范各种方法实现途径,在面对多元数据分析时能够驾轻就熟,从容面对。

【内容介绍】:

第一篇、境多元数生态环境多元数据分析概述据分析概述

1、多元统计方法概念定义

2、纷繁的多元统计方法应用情景、异同点

3、多元统计方法数据或变量类型和结构

第二篇、R基础及数据探索 (Working with R and Data screening)

一:R和Rstudio简介及入门和作图基础

1) R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等

2) R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等

3) R语言数据文件读取、整理&#

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