2024年最新基于conda环境下的宏基因组学分析利器MetaWRAP 1(2)，2024年这些高频面试知识点最后再发一次

最全的Linux教程，Linux从入门到精通

======================

1. linux从入门到精通(第2版)

2. Linux系统移植

3. Linux驱动开发入门与实战

4. LINUX 系统移植 第2版

5. Linux开源网络全栈详解 从DPDK到OpenFlow

第一份《Linux从入门到精通》466页

====================

内容简介

====

本书是获得了很多读者好评的Linux经典畅销书**《Linux从入门到精通》的第2版**。本书第1版出版后曾经多次印刷，并被51CTO读书频道评为“最受读者喜爱的原创IT技术图书奖”。本书第﹖版以最新的Ubuntu 12.04为版本，循序渐进地向读者介绍了Linux 的基础应用、系统管理、网络应用、娱乐和办公、程序开发、服务器配置、系统安全等。本书附带1张光盘，内容为本书配套多媒体教学视频。另外,本书还为读者提供了大量的Linux学习资料和Ubuntu安装镜像文件，供读者免费下载。

本书适合广大Linux初中级用户、开源软件爱好者和大专院校的学生阅读，同时也非常适合准备从事Linux平台开发的各类人员。

需要《Linux入门到精通》、《linux系统移植》、《Linux驱动开发入门实战》、《Linux开源网络全栈》电子书籍及教程的工程师朋友们劳烦您转发+评论

网上学习资料一大堆，但如果学到的知识不成体系，遇到问题时只是浅尝辄止，不再深入研究，那么很难做到真正的技术提升。

需要这份系统化的资料的朋友，可以点击这里获取！

一个人可以走的很快，但一群人才能走的更远！不论你是正从事IT行业的老鸟或是对IT行业感兴趣的新人，都欢迎加入我们的的圈子（技术交流、学习资源、职场吐槽、大厂内推、面试辅导），让我们一起学习成长！

github目录：https://github.com/ursky/metaWRAP

anaconda地址：Login :: Anaconda.org

安装

这里还是介绍conda或mamba安装吧，其他的可能不是最新版，配置起来有时候比较麻烦

conda config --add channels defaults
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels ursky

# 

mamba config --add channels defaults
mamba config --add channels conda-forge
mamba config --add channels bioconda
mamba config --add channels ursky

安装的时候注意了，直接将所有channel都放上，不然缺包错误：

mamba create -y --name metawrap132 -c ursky -c bioconda -c conda-forge metawrap-mg=1.3.2

安装完最后的提示：

查看安装结果，主要看其中metawrap-mg的版本，这里是1.3.2，来自ursky：

mamba list

配置建议数据库

这里是各个数据库，数据库大小，以及各个模块可能使用到的数据库，按实际需求配置，如果没有配置对应数据库，则需要在后续模块中指定或着忽略对应参数：

taxonomy数据库：

# 先删除原配置文件夹
rm -rf /miniconda3/envs/metawrap132/opt/krona/taxonomy
# 自己创建指定文件夹
mkdir /path/on/big/disk/taxonomy
# 创建软链接
ln -s /path/on/big/disk/taxonomy /miniconda3/envs/metawrap132/opt/krona/taxonomy
# 自动下载更新数据库，会自动下载到自己指定的文件夹
ktUpdateTaxonomy.sh

直接查看ktUpdateTaxonomy.sh文件内容，直接下载来自ncbi数据库：

下载解压完成后，在目标目录生成一个taxonomy.tab的文件：

head taxonomy.tab 
1	0	1	    no rank	        root
2	2	131567	superkingdom	Bacteria
6	7	335928	genus	        Azorhizobium
7	8	6	    species	        Azorhizobium caulinodans
9	8	32199	species	        Buchnera     aphidicola
10	7	1706371	genus	        Cellvibrio
11	9	1707	species	        Cellulomonas gilvus
13	7	203488	genus	        Dictyoglomus
14	8	13	    species	        Dictyoglomus thermophilum
16	7	32011	genus	        Methylophilus

GRIDSS\SILVA 16S rRNA\BUSCO数据库

quast-download-gridss
quast-download-silva
quast-download-busco

下载后位于目录：

/miniconda3/envs/metawrap/lib/python2.7/site-packages/quast_libs/

下载日志：

envs/metawrap/lib/python2.7/site-packages/quast_libs/silva/blastdb.log

中间几个数据库下载不下来，更换链接吧，应该是版本变了，地址不对：

busco的数据目录：Index of /v5/data/lineages/

busco的官网：BUSCO - from QC to gene prediction and phylogenomics

最全的Linux教程，Linux从入门到精通

======================

1. linux从入门到精通(第2版)

2. Linux系统移植

3. Linux驱动开发入门与实战

4. LINUX 系统移植 第2版

5. Linux开源网络全栈详解 从DPDK到OpenFlow

第一份《Linux从入门到精通》466页

====================

内容简介

====

本书是获得了很多读者好评的Linux经典畅销书**《Linux从入门到精通》的第2版**。本书第1版出版后曾经多次印刷，并被51CTO读书频道评为“最受读者喜爱的原创IT技术图书奖”。本书第﹖版以最新的Ubuntu 12.04为版本，循序渐进地向读者介绍了Linux 的基础应用、系统管理、网络应用、娱乐和办公、程序开发、服务器配置、系统安全等。本书附带1张光盘，内容为本书配套多媒体教学视频。另外,本书还为读者提供了大量的Linux学习资料和Ubuntu安装镜像文件，供读者免费下载。

本书适合广大Linux初中级用户、开源软件爱好者和大专院校的学生阅读，同时也非常适合准备从事Linux平台开发的各类人员。

需要《Linux入门到精通》、《linux系统移植》、《Linux驱动开发入门实战》、《Linux开源网络全栈》电子书籍及教程的工程师朋友们劳烦您转发+评论

网上学习资料一大堆，但如果学到的知识不成体系，遇到问题时只是浅尝辄止，不再深入研究，那么很难做到真正的技术提升。

需要这份系统化的资料的朋友，可以点击这里获取！

一个人可以走的很快，但一群人才能走的更远！不论你是正从事IT行业的老鸟或是对IT行业感兴趣的新人，都欢迎加入我们的的圈子（技术交流、学习资源、职场吐槽、大厂内推、面试辅导），让我们一起学习成长！