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现在我们以CSV文件保存和加载的性能作为基准。将五个随机生成的具有百万个观测值的数据集转储到CSV中,然后读回内存以获取平均指标。并且针对具有相同行数的20个随机生成的数据集测试了每种二进制格式。
同时使用两种方法进行对比:
- 1.将生成的分类变量保留为字符串
- 2.在执行任何I/O之前将其转换为pandas.Categorical数据类型
1.以字符串作为分类特征
下图显示了每种数据格式的平均I/O时间。这里有趣的发现是hdf的加载速度比csv更低,而其他二进制格式的性能明显更好,而feather
和parquet
则表现的非常好
保存数据并从磁盘读取数据时的内存消耗如何?下一张图片向我们展示了hdf的性能再次不那么好。但可以肯定的是,csv不需要太多额外的内存来保存/加载纯文本字符串,而feather
和parquet
则非常接近
最后,让我们看一下文件大小的对比。这次parquet
显示出非常好的结果,考虑到这种格式是为有效存储大量数据而开发的,也是理所当然
2.对特征进行转换
在上一节中,我们没有尝试有效地存储分类特征,而是使用纯字符串,接下来我们使用专用的pandas.Categorical
类型再次进行比较。
从上图可以看到,与纯文本csv相比,所有二进制格式都可以显示其真强大功能,效率远超过csv,因此我们将其删除以更清楚地看到各种二进制格式之间的差异。
可以看到feather
和pickle
拥有最快的I/O速度,接下来该比较数据加载过程中的内存消耗了。下面的条形图显示了我们之前提到的有关parquet
格式的情况
为什么parquet内存消耗这么高?因为只要在磁盘上占用一点空间,就需要额外的资源才能将数据解压缩回数据帧。即使文件在持久性存储磁盘上需要适度的容量,也可能无法将其加载到内存中。
最后我们看下不同格式的文件大小比较。所有格式都显示出良好的效果,除了hdf仍然需要比其他格式更多的空间。
结论
正如我们的上面的测试结果所示,feather
格式似乎是在多个Jupyter之间存储数据的理想选择。它显示出很高的I/O速度,不占用磁盘上过多的内存,并且在装回RAM时不需要任何拆包。
当然这种比较并不意味着我们应该在每种情况下都使用这种格式。例如,不希望将feather
格式用作长期文件存储。此外,当其他格式发挥最佳效果时,它并未考虑所有可能的情况。所以我们也需要根据具体情况进行选择!
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