运动发酵单胞菌的葡萄糖-果糖氧化还原酶(GFOR)氨基酸序列长度到底是多少

### 1. **争议来源:菌株变异与移码突变**

   - **1996年研究背景**:  

     针对运动发酵单胞菌的某些菌株(如ZM4亚种),发现其 *gfo* 基因存在 **6-bp的缺失**,导致移码突变(frameshift mutation),使翻译提前终止,最终蛋白缩短为381个氨基酸[^1]。

   - **与原始菌株的差异**:  

     早期研究(如ATCC 31821菌株)未检测到此突变,其GFOR仍为387个氨基酸。

 

---

 

### 2. **数据库与文献的协调**

   - **UniProt记录(P11080)**:  

     目前标注的387个氨基酸基于 **ATCC 31821菌株** 的完整基因序列,已通过实验验证。

   - **NCBI记录差异**:  

     - Accession AAA25363.1(387 aa):对应原始菌株。  

     - Accession WP_011145760.1(381 aa):对应ZM4菌株的突变版本。

 

---

 

### 3. **可能解释**

   - **自然突变与实验室传代**:  

     运动发酵单胞菌在长期实验室传代过程中,某些亚株可能积累基因缺失或插入(如ZM4的6-bp缺失),导致功能蛋白的缩短。

   - **功能影响**:  

     381个氨基酸的GFOR仍保留催化活性,但可能影响其稳定性或辅酶结合能力[^2]。

 

---

 

### 4. **如何验证具体序列?**

   - **步骤1:明确菌株来源**  

     若研究对象为ZM4(常用于代谢工程),其GFOR更可能为381 aa;若为ATCC 31821或野生型,则为387 aa。

   - **步骤2:比对基因序列**  

     通过NCBI Nucleotide数据库查询 *gfo* 基因(如基因ID 1452443),检查是否存在6-bp缺失(如ZM4菌株的位置654-659缺失)。

 

---

 

### 5. **结论**

   - **两种长度均正确**,但对应不同菌株:  

     - **387 aa**:野生型(如ATCC 31821)。  

     - **381 aa**:携带移码突变的亚株(如ZM4)。  

   - **建议后续操作**:  

     在研究中需明确菌株信息,并通过PCR或测序确认目标基因的完整性。

 

---

 

[^1]: 来源:*Microbiology* (1996), 142(4), 985-990.  

[^2]: 功能验证:*Applied and Environmental Microbiology* (2003), 69(2), 973-981.

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值