医学学术小白如何轻松科研——用AI助力医学实验，从Western Blot到流式轻松预测细胞凋亡

在我们刚学会实验准备上手的时候，多多少少还是会有疑惑，得出来的结果可能会五花八门。到底哪些结果是相对合理的，而哪些结果是可能被误差所影响的，会对我们造成巨大的困扰。很多时候我们需要查阅大量的文献来解决这些困惑，十分的耗时耗力。在这种时候，我们可以用行学AI来帮我们预测一个相对合乎常理的结果；同时遇到不符合预期的结果我们也可以用行学AI来进行分析。

就拿最基础的Western Blot来说，当我们需要检测同一个指标蛋白的含量时，有些蛋白会上升，有些蛋白会下调，甚至有些蛋白的双条带一个上升一个下调，这可能是每一个刚开始跑WB的同学都经历过的噩梦时刻。这时我们就可以用行学AI帮我们先预测这些蛋白的趋势。假设我们现在在做一个关于小分子药物诱导肿瘤细胞凋亡的研究，我们需要探究药物会诱导哪些蛋白的变化，这是我们可以在行学AI中输入“我想用抗肿瘤药物处理肿瘤细胞，然后用WB检测凋亡水平，哪些蛋白会有变化，有什么趋势”

我们可以看到，行学AI给出了几种常见的凋亡蛋白的变化趋势：

促凋亡蛋白Bax的表达水平会上升。

Caspases家族（如Caspase-3、Caspase-9）会被激活，变为Cleaved形势，可以检测到Cleaved-Caspase的上调。

抗凋亡蛋白Bcl-2和Bcl-xL可能会减少，因为它们通常抑制凋亡。

凋亡标志物PARP（聚ADP核糖聚合酶）在凋亡过程中会被Caspase-3等剪切，表现为一条或多条剪切产物带的出现。

这时我们就可以在检测这些蛋白时有个大概的认识，也有助于我们在验证这些蛋白的趋势时去除实验原因产生的误差。

我们在做别的实验的时候也可以选用行学AI来帮我们预测实验结果。还是拿检测凋亡举例，我们在检测凋亡时往往需要两到三个不同的实验来辅助预测你的推论，我们可以先直接问行学AI“还有哪些检测凋亡的方法”

我们可以看到行学AI给出了多种检测凋亡的手段，这时我选用最常用的Annexin V/PI双染流式细胞数检测，流式的检测结果我们也可以直接用行学AI来预测，行学AI指出

活细胞：Annexin V阴性，PI阴性（双阴）。这种组群通常位于流式细胞图的左下象限，表示细胞外膜完整，没有PS外翻及DNA损伤。在经过处理后应该是下降的趋势。

早期凋亡细胞：Annexin V阳性，PI阴性。这些细胞在流式细胞图中应出现在右下象限，表明细胞膜早期凋亡特征，PS外翻但膜仍然完整，没有被PI染色。应该是上调的趋势。

晚期凋亡或坏死细胞：Annexin V阳性，PI阳性。这一组显示在右上象限，代表细胞膜失去完整性，PI能够进入细胞，与Annexin V标记的PS外翻共同表明凋亡的晚期或者细胞坏死。同样也应该是上调的趋势。

坏死细胞（直接坏死，而不是从凋亡转化而来）：Annexin V阴性，PI阳性，位于左上象限，表示细胞膜破损但没有PS的早期外翻。大部分情况应该是变化趋势不大，但是药物要是有直接诱导细胞坏死的功能的话有可能会上调。

在我们做完实验后，有可能会发现实验结果与预测结果不同的情况，这时候我们需要对实验结果进行分析。同样的，我们也可以用行学AI来辅助我们分析。就比如我们在做蛋白验证时，同时用WB检测蛋白水平和qPCR检测mRNA水平的变化，按道理来说mRNA与蛋白的变化趋势应该是一样的，但是实验结果发现蛋白水平下调，mRNA水平却存在上升的趋势，对于这一匪夷所思的结果我们也可以用行学AI来帮助我们进行分析。我们在行学AI中输入“用Western Blot检测蛋白后发现蛋白下调，但是用qpcr检测后发现基因上调，这是什么原因”可以看到行学AI给出的答案：

翻译效率差异：mRNA的增加不一定保证其被高效翻译成蛋白质。翻译效率可能受到翻译起始、核糖体占据和tRNA供应等因素的影响。

蛋白质降解：蛋白质可能通过蛋白酶体途径或溶酶体途径被加速降解。这可能是由于蛋白质的翻译后修饰，如泛素化，标志其降解。

mRNA稳定性与转录：qPCR检测到的mRNA上调可能是由于mRNA的持续转录和积累，但实际的翻译需求和细胞内环境可能不支持相应增量的蛋白质合成。

翻译后修饰：翻译后修饰（如磷酸化、糖基化）可能影响蛋白质的稳定性、功能或检测，尽管总量减少，但未修饰或错误修饰的蛋白质可以被降解。

技术因素：Western Blot和qPCR都有各自的实验偏差，包括样品处理、抗体特异性、PCR引物设计、反应效率等，可能导致结果不一致。

细胞信号反馈：有些情况下，细胞内调节机制可能会对mRNA和蛋白质水平进行反馈控制，例如通过激活某些信号通路反过来抑制蛋白的产生。

实验时间点选择：可能存在时间滞后效应，mRNA的上调未必立即导致蛋白质水平的变化，或蛋白质合成后立即被快速降解。

同时行学AI也给出了后续的解决方案有助于进一步研究：

当然，在我们借助AI进行预测时应该是把它的结果当作一个参考，而不是对着这个结果来做，在进行医学实验研究的时候我们应该时刻保持实事求是的态度，就算是阴性结果有时候也是一种发现。