信号识别粒子(SRP)是一种靶向部分新生前分泌蛋白到内质网膜的细胞质核糖核蛋白。
该研究从分子进化的角度考虑了SRP环路,使用最近确定的基因或cDNA编码SRP(7SL)RNA的同源物,Srp54蛋白(Srp54p)和SRP受体的α亚单位(SRα)及哺乳动物SRP的其余五个多肽。
分析提供了对SRP核酸结构变异的重要见解,并确定了该途径蛋白成分中的新保守基序。
这项研究揭示了SRP核心的紧密结合序列结合蛋白复合物以及SRP RNA的松散结合的IV区域可能是SRP的最小功能单元。
比较序列分析显示,来自不同物种的Srp54p同源物的蛋氨酸丰富的M区域具有类似最近鉴定的RNA识别基序的扩展区域。
此外,SRα和Srp54p同源物的G区域显示显著相似性,表明这两个多肽不仅在四个GTP酶结合部位上相似,还包括一个与大肠杆菌EF-Tu的鸟苷酸解离刺激物(GDS)结合位点类似的九个连续氨基酸残基。
SRP核心组件的保守性以及早期对SRP循环的基因和生物化学研究的结果,推断Srp68/72p异源二聚体的一个组分可用作Srp54p和SRα的GDS。
总体而言,该研究发现SRP循环组件在来自三大分支的生物中具有保守性,暗示这种蛋白质导出途径是古老进化的起源。