单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术为肿瘤提供强劲的方法

随着单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）技术的不断进步，Fang等人进行了一个整合的研究，从而揭示了乳腺癌内分泌耐药性中的肿瘤细胞的表观遗传调控状态。他们在超过8万个乳腺组织细胞中，包括两个正常组织、三个原发肿瘤和三个他莫昔芬治疗的复发肿瘤，开展了整合的分析。研究定义了多种不同的细胞类型，确定了原发和复发肿瘤特异的癌细胞状态（CSs），并通过这种整合分析推导出一个多样性导向的核心特征（HCS）。该研究的功能实验验证了HCS中一个关键基因BMP7的致癌作用。研究揭示了在六种肿瘤组织中存在着显著的细胞间异质性，并勾画了从原发到复发肿瘤的进展过程。研究定义了九个CSs，包括五个原发病灶特异性、三个复发病灶特异性和一个原发-复发共享的CSs，并确定了不同的CSs的开放染色质区域，以及一个包含137个基因的HCS。最终，研究证明BMP7通过调节MAPK信号通路在他莫昔芬耐药性乳腺癌细胞中发挥致癌作用。因此，这项综合的单细胞分析提供了对他莫昔芬耐药性乳腺癌中肿瘤异质性的全面理解，为揭示表观遗传因素和肿瘤微环境如何影响肿瘤异质性，并发现规避与异质性相关失败的潜在治疗靶点提供了有力方法。