CANOCO5.0实现冗余分析（RDA）最详细步骤

最新推荐文章于 2024-04-21 13:08:21 发布
最新推荐文章于 2024-04-21 13:08:21 发布
阅读量1.1w 收藏 45
点赞数 9
文章标签： 图像处理
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/Along6/article/details/132571797
版权

在地理及生态领域会常使用RDA分析，RDA的实现路径也有很多，今天介绍一下CANOCO软件的实现方法。

1.软件安装

时间调整到2010年

2.数据处理

得有不同的物种或者样点数值，再加上环境因子数据。

3.软件运行

4.结果解读

结果解读主要把握这几点：

1.不同样点和环境因子之间夹角是锐角 是正相关，是钝角是负相关

2.夹角越大 说明相关性较小，夹角越小，相关性越大

3.箭头越长 相关性越大

邢庆阳
关注
  • 9
    点赞
  • 踩
  • 45
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 打赏
    打赏
  • 5
    评论
canoco5冗余分析步骤_群落分析的冗余分析（RDA）概述
weixin_39605463的博客
11-21 1万+
约束排序之冗余分析(RDA)概述前篇先后简介了主成分分析(PCA)、对应分析(CA)、主坐标分析(PCoA)以及非度量多维尺度分析(NMDS)。这些排序方法均属于非约束排序，只涉及一个数据矩阵，并在低维空间中尽可能呈现原始的数据结构。非约束排序方法中不存在解释变量(对于物种多度数据而言，解释变量通常指代环境因素)，尽管可以通过相关性或多元回归的方式被动添加至排序空间中。与此相比，约束排序...
怎么用spss做冗余分析_【攻略】手把手教你怎么用SPSS做统计分析
热门推荐
weixin_39635373的博客
12-20 1万+
使用SPSS软件进行数据分析一个严谨的实验，在获得实验数据的那一刻，数据的处理与分析，就显得尤为重要，今天先聊聊主成分分析，以城市分析为例子，大家延伸思考吧，文档已通过论证。想跟师兄交流实验数据问题，加我微信：laiwenshixiong，申请时，记得填写申请理由，格式为：真实姓名+所学专业+学校或单位，例如：高鹏+生化专业+浙江大学。切入正题：主成分分析【例子】以全国31个省市的8项经济指标为例...
Canoco5.生态统计软件
03-18
非常实用的生态统计软件，PCA，CCA，排序，聚类，都可以操作，非常实用。
canoco 5 教程.pdf
01-23
canoco是一款生态数据处理软件，这是一款专业性极强的软件，一般的不从事生态研究的人，也不会用到该软件。而在生态研究上，该软件表现得非常专业，它能够对生态学方面的数据进行专业处理，同时涉及的领域也是非常广泛。还可以帮助用户找到研究问题最合适的分析方法，是每个研究人员的好帮手。
CANOCO-CCA分析简明教程
12-14
CCA分析简明教程，详细介绍了如何用CANOCO进行CCA分析
canoco数据分析CCA、PCA、RDA
01-13
在生态学统计分析中用的PCA、CCA、RDA均能通过canoco实现
canoco中文简明教程
04-14
Canoco for Windows 是新一代的 CANOCO 软件，是生态学应用软件中用于约束与非约 束排序的最流行工具。Canoco for Windows 整合了排序以及回归和排列方法学，以便得到健 全的生态数据统计模型。Canoco for Windows 包括线性和曲线单峰方法。使用 Canoco for Windows 进行排序，能够洞察： ● 生物群落结构 ● 植物与动物群落以及它们的环境之间的联系 ● 一个对环境和(或)其生物群落的假设冲击所能造成的影响 ● 在生物群落上进行的复杂生态学和生态毒理学实验的相关处理所能造成的影响 一个排序被计算出来后，排序图可以立即显示在显示器上。Canoco 具体独特的能力，可 以说明用协变量表示的背景变异，而用它的扩展工具来进行排列测试，包括测试的互动效果。 这些独特的特性使得 Canoco for Windows 能特别有效的解决应用研究方面的问题。 二 软件模块 The Canoco for Windows 软件包主要包含以下几个模块： ● Canoco for Windows：软件包的核心，用来指定要分析的数据和排序模型，排序方法 以及分析结果的查看等基本操作命令均被集中在该模块的对话框中 ● WcanoImp ： 将以电子表格形式（Excel 等）保存的外部数据转化为 CANOCO 识别的 形式 ● CanoDraw 4.0 for Windows：用来绘制各种类型的排序图，同时也可以生成多种等值 线和回归模型图，并进一步深层次发掘排序结果，该模块可以直接从主程序界面工 具栏激活 ● CanoMerge：合并 Canoco 识别的 dta 类型数据文件，并可以将数据文件以带制表分 隔符的文本形式输出（基本常用统计软件均兼容该类型文件），同时该模块具有滤掉 低频率物种的功能 ● PrCoord：对特定数据集进行主坐标分析以及冗余分析
canoco5冗余分析步骤_高德 JS 依赖分析工程及关键原理
weixin_39642687的博客
11-28 704
一、背景高德 App 进行 Bundle 化后，由于业务的复杂性，Bundle 的数量非常多。而这带来了一个新的问题——Bundle 之间的依赖关系错综复杂，需要进行管控，使 Bundle 之间的依赖保持在架构设计之下。并且，为了保证 Bundle 能实现独立运转，在业务持续迭代的过程中，需要逆向的依赖关系来迅速确定迭代的影响范围。同时，对于切面 API（即对容器提供的系统 API，类似浏览器中的...
怎么用spss做冗余分析_SPSS在线_SPSSAU_SPSS典型相关分析
weixin_39705931的博客
02-05 4114
4、SPSSAU输出结果此表格展示出典型变量的提取情况，上表中共显示有5个典型变量被提取出来，在进行F检验时显示，其中仅2个典型变量是呈现出0.01水平的显著性，因此，最终应该以两个典型变量为准进行后续研究。并且第一个典型变量的相关系数值为0.763，第二个典型变量为0.706，相关系数值较高，说明典型变量之间有着紧密的正向相关关系。此步骤非常重要，共提取出2个典型变量，并且直接得出典型变量对的相...
canoco5主成分分析步骤_主成分分析(principal component analysis)
weixin_39846378的博客
11-27 1060
一、主成分分析的思想 主成分分析是数据处理中常用的降维方法。我们需要处理的数据往往是高维数据，把它看成是由某个高维分布产生。高维分布的不同维之间可能具有较强的相关性，这也就为数据降维提供了可能。为了叙述清楚主成分分析的思想，我们通过二维数据进行叙述，即数据是由随机向量 产生，并假设 。通过该分布得到的样本点如图下所示：如果我们把每个数据点用 表示，那么，每个数据是二维的。实际上，容易发现，...
CANOCO使用说明
04-27
CANOCO使用说明；英文版；对CANOCO软件最为详细的说明，但是可能有点长，需要耐心看
Canoco中文简明教程
05-15
经典生态学数据分析软件Canoco的中文简明教程，很适合初学者一步一步进行学习。
rda_2_r_冗余分析_vpa方差分析_
10-01
冗余分析（Redundancy Analysis, RDA）是一种在生态学和环境科学中广泛应用的多元统计方法，它结合了主成分分析（PCA）和回归分析的特性，旨在探索和解释多变量数据集中的关系，特别是在环境变量与生物多样性之间。...
Canoco软件的PCA教程
12-01
* Canoco 软件不仅可以进行 PCA 分析，还可以进行 RDA、CCA 等分析。 * Canoco 软件可以对物种生存环境对生物的影响进行研究。 * Canoco 软件可以对理化因子数据进行同样的操作。 Canoco 软件的 PCA 教程涵盖了从 ...
Canoco中文教程.docx
06-20
Canoco 5 是一款专业的数据分析软件，主要用于 PCA（Principal Component Analysis，主成分分析）和 RDA（Redundancy Analysis，冗余分析）等多元统计分析方法。下面是 Canoco 5 中文教程的知识点总结： 1. Canoco ...
Canoco-5.0软件应用(PPT文档).ppt
10-20
- **冗余分析（RDA）**：一种环境解释的排序方法，分析物种和环境变量之间的关系。 **术语解释** - **响应变量**：研究中的因变量，通常指物种数据。 - **解释变量**：自变量，通常包括主环境变量和协环境变量，...
生物学重复对RDA分析的影响
03-31
一般微生物测序实验会包含三个生物学重复，然后获得有重复的OTU table和环境因子的数据。许多文献在对OTUs进行冗余分析时都包含了...下面我们以基于距离的冗余分析（db-RDA）作为例子，尝试分析一下，看看两者的区别。
R语言：冗余RDA分析（结合回归和主成分分多元的排序方法）+置换检验+变差分解图
最新发布
weixin_46587777的博客
04-21 1257
结合回归分析和主成分分析的排序方法使用：vegan包的rda()函数数据准备：变量之间要一一对应（比如都为30个样方）绘制RDA排序图（参数设置）参考R语言实践第三章：图形初阶RDA结果的置换检验：anova()注意：与方差检验无关。
面试官：给我讲一下分库分表方案
代码技巧
07-30 515
作者：尜尜人物链接：https://www.cnblogs.com/littlecharacter/p/9342129.html一、数据库瓶颈1、IO瓶颈2、CPU瓶颈二...
R语言进行RDA冗余分析
08-21
R语言中可以使用"vegan"包来进行RDA（Redundancy Analysis）冗余分析。下面是一个简单的示例代码： ```R # 安装和加载所需的包 install.packages("ve＊＊＊") library(ve＊＊＊) # 创建一个数据框，其中包含你的自变量和因变量 data <- data.frame( X1 = c(1, 2, 3, 4, 5), X2 = c(2, 4, 6, 8, 10), Y1 = c(3, 6, 9, 12, 15), Y2 = c(4, 8, 12, 16, 20) ) # 进行冗余分析 rda_result <- rda(data) # 打印结果 summary(rda_result) ``` 在这个示例中，我们创建了一个包含自变量（X1、X2）和因变量（Y1、Y2）的数据框。然后，我们使用rda函数对数据进行冗余分析，并使用summary函数打印结果。你可以根据自己的数据进行相应的修改和分析。
评论 5
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

邢庆阳

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值