HPRD数据库HPRD_Release9_062910表中最后一列RefSeq字段的含义

RefSeq — 是NCBI数据库的参考序列

RefSeq 资 料 库 是 NCBI 将 GenBank 的 序 列 再 做 详 细 整 理 的 non-redundent 序 列 资 料 库 , 它 的 序 列 格 式 和 GenBank 几 乎 完 全 相 同 , 但 因 为 是 完 全 不 同 的 独 立 资 料 库 , 为 与 GenBank 区 别 , RefSeq 的Accession Number 格 式 和 GenBank 不 同 , 会 是 ：

NT_123456 constructed genomic contigs

NM_123456 mRNAs

NP_123456 proteins

NC_123456 chromosome

假 使 得 到 的 output file 中 有 ref , 就 代 表 所 找 到 的 是 RefSeq 资 料 库 的 序 列 :

ref|NM_00014|A2M| Homo sapiens alpha-2-ma....

gi|4557284|ref|NM_00646.1|[4557284]