生物界地震，AlphaFold破解50年重大挑战，AI+X将迎来新时代

2016年，DeepMind开发的人工智能围棋 AlphaGo 曾横扫顶尖人类围棋职业选手，给无数人带来了深刻的心灵震撼，也同时让人工智能再一次进入到大众的眼中，带来新一波的人工智能热潮。

 

在此之后，DeepMind迅速将目光聚焦在蛋白质折叠这一问题上。2017年10月，在一次公开采访中，DeepMind团队表示，他们开始对人工智能在药物开发中的应用感兴趣，而新药开发的关键一步，就是对靶点蛋白质三维结构的精准测算。

 

2018年的11月2日，在第13届全球蛋白质结构预测竞赛（CASP）上，AlphaFold获得了预测43种蛋白中的25种蛋白结构的最高分，在98名参赛者中排名第一。随后在2019年1月，DeepMind将AlphaFold模型与代码通过《nature》发布，并登上封面。

       

2020年11月30日，DeepMind官网宣布，其新一代AlphaFold人工智能系统，在国际蛋白质结构预测竞赛（CASP 14）上击败了其余的参会选手，能够精确地基于氨基酸序列，预测蛋白质的3D结构。其准确性可以与使用冷冻电子显微镜（CryoEM）、核磁共振或 X 射线晶体学等实验技术解析的3D结构相媲美。

       

 

据其官网博客显示，AlphaFold 2 对所有蛋白靶点3D结构预测的中位GDT评分为92.4分；即便是针对最难解析的蛋白靶点，AlphaFold的中位GDT评分也达到了87.0分。在接受检验的近100个蛋白靶点中，AlphaFold对三分之二的蛋白靶点给出的预测结构与实验手段获得的结构相差无几。“在有些情况下，已经无法区分两者之间的区别是由于AlphaFold的预测出现错误，还是实验手段产生的假象。”

对这一结果，《Nature》直接发文称：It will change everything。由此可见一斑。

 

 

生物学界对这一结果激动不已，认为这将是该领域多年以来最为振奋的结果。

 

人工智能领域同样振奋不已，这或许意味着人工智能破圈、出圈的时刻到了，AI + X 将迎来新时代。

 

关于 AlphaFold 2 的具体细节，在短时间内国内已经有不少中文报道和翻译，具体可以参见以下文章 ——

 

【1】DeepMind 官宣文章：

标题：AlphaFold: a solution to a 50-year-old grand challenge in biology

https://deepmind.com/blog/article/alphafold-a-solution-to-a-50-year-old-grand-challenge-in-biology

【2】Nature文章：“我认为这将对蛋白质结构预测领域造成极大改变。我怀疑许多人会离开该领域，因为核心问题已经解决了。”

标题：‘It will change everything’: DeepMind’s AI makes gigantic leap in solving protein structures

 

https://www.nature.com/articles/d41586-020-03348-4

 

【3】药明康德，从医药的视角看 AlphaFold 的突破

标题：解决生物学50年来的重大挑战！生物界“AlphaGo”精准预测蛋白质结构

【4】机器之心，媒体视角下的中文报道

 

标题：「它将改变一切」，DeepMind AI解决生物学50年来重大挑战，破解蛋白质分子折叠问题

【5】知乎用户，从 CASP14 与会者的视角提供的一线专业信息

 

标题：AlphaFold2！！！！！！！(会议持续更新中)

https://zhuanlan.zhihu.com/p/315497173?utm_source=wechat_session&utm_medium=social&utm_oi=73482918428672&wechatShare=1&s_r=0

【6】AI 科技评论，媒体视角下的解读

标题：DeepMind推出二代AlphaFold，破解蛋白质分子折叠，生物学或遇“未有之变局”

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