使用ggpolar绘制生存关联网络图的R语言代码
生存关联网络图是一种用于可视化生存分析结果的有力工具。它可以显示不同变量之间的相关性以及它们与生存时间之间的关系。在R语言中,我们可以使用ggpolar包来创建生存关联网络图。本文将介绍如何使用ggpolar包来绘制生存关联网络图,并提供相应的R语言代码示例。
首先,我们需要安装并加载ggpolar包。可以使用以下代码安装ggpolar包:
install.packages("ggpolar")
加载ggpolar包:
library(ggpolar)
接下来,我们需要准备用于创建生存关联网络图的数据。通常,我们使用生存分析的结果数据,其中包括变量的生存时间、事件状态以及其他与生存相关的变量。在本示例中,我们使用自带的survival包中的lung数据集。
library(survival)
data(lung)
在绘制生存关联网络图之前,我们需要计算变量之间的相关性。我们可以使用相关系数(如皮尔逊相关系数)来度量变量之间的线性相关性。下面的代码计算了lung数据集中各个变量之间的相关系数:
correlation_matrix <- cor(lung[, -1])
接下来,我们根据相关系数矩阵创建关联网络图。我们可以使用ggpolar包中的ggpolar()
函数来绘制关联网络图,并使用geom_edge()
函数添加边。下面的代码演示了如何创建生存关联网络图:
ggpolar() +
geom_edge(data = as.data.frame(as.table(cor