顶尖学术盛宴,CADD计算机辅助药物设计,AIDD人工智能药物发现与深度学习基因组概述

本文概述了计算机辅助药物设计(CADD)如何利用生物科学信息进行新药设计,以及人工智能药物发现(AIDD)如何通过机器学习和深度学习加速新药研发。深度学习在基因组学中的应用也得到了强调,它可以提高疾病诊断和治疗的效率。顶尖学术活动邀请函发出,聚焦CADD、AIDD和深度学习基因组学的最新进展。
摘要由CSDN通过智能技术生成

 CADD(Computer Aided Drug Design):计算机辅助药物设计,依据生物化学、酶学、分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果,针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受体、离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点,并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征,以计算机化学为基础,通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的相互作用,考察药物与靶点的结构互补、性质互补等,设计出合理的药物分子。它是设计和优化先导化合物的方法,特别是在食品、生物、化学、医药、植物、疾病方面应用广泛!

         AIDD(AI Drug Discovery & Design):是近年来非常火热的技术应用,且已经介入到新药设计到研发的大部分环节当中,为新药发现与开发带来了极大的助力。倾向于机器对数据库信息的自我学习,可以对数据进行提取和学习,一定程度上避免了化合物设计过程中的试错路径,同时还会带来很多全新的结构,为药物发现打破常规的结构壁垒。覆盖了机器学习和深度学习,能与新药研发相结合并实质性的应用到靶点预测、高通量筛选、药物设计、药物的ADMET性质预测等;且算力方面,由早期应用于药物发现领域的决策树、随机向量机等机器学习模型,进展到深度神经网络、卷积神经网络、循环神经网络等深度学习算法。具体到新药研发环节:如靶点识别,基于决策树来预测与疾病相关的基因,有研究者发现了多种EF在信号通路和胞外定位中的调控作用,并进一步基于靶点的结构和几何特征,选取一定量蛋白的数十个结合位点以及大量的非药物结合位点,构建随机森林分类器来预测药物靶点,并有研究者进一步采样提升了随机森林算法,成功的从非药物靶点中区分了药物靶点。再如,活性筛选方面,AIDD可以对候选化合物进行筛选,从而更快的筛选出作用

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