1. R语言学习准备工作

1.R的安装

R软件地址

在CARN找到，根据安装需求安装对应系统的R软件，例如windows的。先安装base里面的最新安装包，之后安装Rtools里面最新的安装包。

2.Rstudio的安装

安装完R之后，安装Rstudio软件即可。

设置工作路径

getwd() #查看工作路径

setwd(dir = “your path”) #设置工作路径，路径格式如"F:/RData"，且路径必须是英文，且最好为硬盘下第一级目录

 

3.R的生信分析必备的包

install.packages("BiocManager")

使用改代码，可以安装生物信息分析必备的包“BiocManager”，之后可以用library()加载已安装的包

library(BiocManager) 

Rstudio每次开始使用，都要重新加载包，所以每次使用前要用library() 加载所有需要的包，其他正常的包也可以使用这些代码安装。

4.设置镜像

使用代码

chooseBioCmirror()

选择离你最近的镜像网站，可以选择5，清华的镜像网站，之后安装包可以更快。

到此就可以正常使用Rstudio工作和学习了。