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原创 20201204 FPKM值
有参数据返回。文件2个,SE.geneEXP和PE.geneEXP。SE.geneEXP打开后发现只有这些信息,猜测应该与基因组数据进行比较学习。PE.geneEXP打开后发现这些信息。FPKM值的概念:Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments 每千个碱基的转录每百万映射读取的fragments比如,对应到该基因的read有1000(10^3)个,总reads个数有1百万(10^6),而该基因的
2020-12-04 16:29:39 7878 1
原创 20200805 迟迟的开启
第一次接触转录组是硕士时为了保证毕业论文“故事”的完整性,小导杨姐姐的建议。当时只明白转录组是需要高质量RNA 上机测序获得大量数据,从中可以查找自己的目的基因。目的也明确,就是找到想要的GnRH 及其受体的序列信息。于是,准备组织,送样,提取RNA,保证质量,惴惴不安的等待结果。结果果然不出所料,找不到我的GnRH。于是曲线救国,找GPCRs。接着写毕业论文,一头雾水,完全不知道什么内容要放进去,怎么讲解,于是“凭感觉”加“照葫芦画瓢”搞定了PPT。分割线。。。。。。。。201
2020-08-05 17:07:24 136
空空如也
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